最初的版本《遊仙窟》壹書大約是唐朝文人張鷟年輕時所作。然而書成後不久即流傳到了日本，據《舊唐書》：日本“每遣使入朝，必出重金購其文”,此後，由於中國本土的文化氣候有所變化，經歷了宋、元、明、清，這本書就徹底在中國失傳了。 日本有《遊仙窟》的多種鈔本和刊本，其中主要的有：
京都醍醐寺三寶院藏康永三年（1344）鈔本，後有日本古典保存會1926年影印本；
名古屋真福寺寶生院藏文和二年（1353）鈔本，後有日本貴重古籍刊行會1954年影印本；
江戶時代（1603—1868）初期無刊記刊本，後有日本和泉書院1983年影印本；
慶安五年（1652）刊本；
元祿三年（1690）刊本，稱《遊仙窟鈔》，分作五卷，有插圖。此本最為通行，後有多種翻刻本。 清朝末年，學者楊守敬從《經籍訪古誌》中將此書抄回中國本土，但未引起人們的關註。
“五四”運動後，魯迅在其《中國小說史略》中正式講到這篇作品，才引起了學界的註意。國人重新引進，先後出版了多種刊本，其中主要的有：
1928年海寧陳氏慎初堂校印本，收入《古佚小說叢刊》；
1929年，章矛塵（廷謙，筆名川島）將魯迅收藏的《遊仙窟》刻本整理標點出來，由魯迅校閱並作序，交由北新書局公開出版，此書始成為中國學界議論的壹個熱點。後有上海書店1985年影印本，為“魯迅作序跋的著作專輯”之壹；
1931年神州國光社《唐人小說》本，汪辟疆校點。後有多種重排新印本；
1955年古典文學出版社社版，方詩銘校註；
2010年中華書局版，李時人、詹緒左校註。
諸本中以晚出的中華版《遊仙窟校註》為最佳；而章矛塵校點本在出版史上最為有名，因為此本有魯迅先生的序言，其校點中又包含了魯迅以及周作人的不少意見。