隨著儒學在中國封建社會中定於壹尊，歷代學者紛紛為諸經作註解。其中，漢朝及稍後的學者們做了大量的註釋工作，人們稱之為註或箋。 唐宋時期，由於時代久遠，人們對漢代的註釋也難於理解了。於是壹些學者不僅註解經傳的正文，而且對前人的舊註也進行解釋和闡發，習慣上就稱之為“疏”或“正義”。
歷代解釋十三經的著作很多。南宋以前，註和疏本來都是單獨成書的。
南宋時期始合刻在壹起。南宋紹熙年間始有匯集唐宋之前最具權威性的“十三經”註、疏的合刊本，形成壹整套經書及其註文，稱為《十三經註疏》，後復有十行本。明嘉靖時期有閩本，據十行本重刻；萬歷間有監本，據閩本重刻；崇禎時期有毛氏汲古閣本，據監本重刻。但是明代時期的監本和汲古閣本，因輾轉翻刻，訛謬百出。
清初有武英殿本。清嘉慶時期，著名學者阮元主持重刻《十三經註疏》，裒集宋本重刊，以十行本為主，並廣校唐石經等古本，撰《校勘記》附於諸經卷末，號為善本，是迄今為止最好的本子,素來為世人所看重。