無論是萬文核桃還是金剛菩提，任何壹種萬文書都可以用清水洗，因為這個階段的核桃都是飽水的，不會因為吸水而開裂。玩了很久的萬文核桃，體積已經縮水，水分已經排幹，所以這個時候再用水洗肯定會開裂，而且沈澱多年的包漿也會因為水洗導致顏色變深。
雖然在盤子上玩過的萬文核桃不能用水清洗，但還是有辦法清洗的。先把鬃刷打濕，輕刷核桃面。如果有頑固汙漬，可以在汙漬軟化後用鉤針輕輕去除。然後要用餐巾紙把核桃包緊，充分吸收核桃表面的水漬。吸幹水分後，將核桃裝入密封袋中，過幾天再取出，既能清洗核桃，又能保證萬文核桃不會開裂。