1997萬芳數據(集團)公司成立；中國科技信息網，國內首家科技信息網站，對外提供服務。
1999萬芳數據(集團)公司在全國建立了300個服務中心。
萬方數據有限公司成立於2000年，在北京、上海、深圳、武漢、沈陽、Xi安設有分公司。“萬芳數據資源鏡像系統”啟動。
2001，“信息中國論”推廣活動遍布全國400多所高校；推出“萬芳數據醫療鏡像系統”；並與中國高等教育文獻保障系統(CALIS)達成戰略聯盟。
2002年萬方數據資源系統和鏡像系統全面改版；成立了數據處理子公司——北京智庫春天數據處理有限公司。
2003年，萬芳數據有限公司啟動海外市場；通過ISO9001:2000質量管理體系認證；醫藥、通信、電力行業的競爭情報系統獲得“新產品證書”。
2004年，“知識服務銀行”巡回講座在全國各地舉行。上海子公司成立。
2005年萬芳數據成立五周年；從學術與產業融合的角度，通過論壇、展覽、影視宣傳等多種形式，專家學者、企業多方參與，將五周年慶典推向高潮。
2006年，從信息資源服務向知識門戶和技術服務轉變；實現分布式存儲和服務，打造中文知乎門戶深度開發的全新電子商務平臺；萬方數據的“知識服務”系統退出；“跨越檢索，走向知識發現”產品發布會在全國各省市啟動。
2007年成立萬芳數據技術研究所，跟蹤研究國際行業發展趨勢，基於公司中長期發展規劃，開展基礎性、前瞻性研究工作；萬方數據成為DOI(數字對象標識符，是科技信息資源整合和互聯互通的重要標準)的唯壹中國代理註冊機構，從而將DOI帶入中國；萬方數據“知識服務系統”上線；“跨越檢索，走向知識發展”產品發布會在全國各省市啟動。
2008年，萬芳數據與中華醫學會簽署戰略合作協議，獲得中華醫學會旗下115醫學核心期刊獨家數字出版權，這是信息服務商與信息資源源合作的第壹個範例。“強強聯合，共創* * *共贏，開啟數字化服務未來——中華醫學會數字化期刊體系”產品發布會在全國各省啟動；“萬芳數據資源管理與服務系統”獲2008年北京市科技三等獎；萬方視頻數據庫服務軟件被上海市科委授予“市重點新產品”。萬方數據庫及用戶系統軟件獲上海市人民政府頒發的科學技術獎三等獎。萬方數據創新資源服務系統軟件V1.0被認定為“上海市高新技術成果轉化項目”；成為國家奧林匹克文獻信息中心的合作夥伴；圖靈獎獲得者、CNRI總裁Robert E. Kahn博士，CNRI Handle system首席架構師Sam Sun先生到訪；萬方數據等五家單位聯合主辦的“圖書館與數字對象唯壹標識研討會(DOI)”在北京召開；萬方數據知識服務平臺簽約服務網站正式上線，打造線上服務新模式；第六屆全國核心期刊和期刊國際化與網絡化研討會在廣西南寧召開。
2009年，與華中科技大學同濟醫學院共建醫學信息素養培養與創新聯合實驗室。與中南大學湘雅醫學院聯合成立“醫學知識服務創新聯合實驗室”；在三亞成功舉辦主題為“推動產業升級，實現合作共贏”的三亞論壇；以“改革、創新、科學發展”為主題的第七屆全國核心期刊期刊國際化與網絡化研討會在昆明召開，由公司、中國科技期刊編輯學會、中國科技信息研究所共同主辦。萬方數據的“中文數字對象識別(DOI)註冊與服務系統”獲得第三屆中國數字出版博覽會“創新技術獎”。
2010慶祝萬芳數據成立十周年；與中華醫學會續簽《中華醫學會系列雜誌數據庫》獨家合作協議；中國質量檢驗出版社(中國標準出版社)與萬芳數據簽署戰略合作合同；公司與中國科技期刊編輯學會、中國科技信息研究所共同主辦的第八屆全國核心期刊和期刊國際化與網絡化研討會；知識服務平臺推出移動閱讀計劃；知識服務平臺的個人用戶站點和簽約用戶站點結合了用戶登錄和支付功能；在個人論文在線相似性檢測系統的基礎上，介紹了壹種批量論文相似性檢測工具。DOI成為ISO標準；在全國各地舉辦數字地圖研討會。
2011，新聞出版總署重大科技項目憑借相似度檢測技術和DOI註冊技術入選；成功舉辦以“推動科技創新引領產業發展”為主題的三亞論壇；在雲南昆明召開“2011年學位論文管理交流會暨科研誠信與研究生教育研討會”；在武漢、鄭州、昆明、呼和浩特等地舉辦了以“探討數字地圖應用與新服務進入知識服務新時代”為主題的數字地圖應用與新服務研討會。