醫書《金匱要略》是張仲景《傷寒論》的重要組成部分。應該說《傷寒論》和《金匱要略》這兩部著作被稱為《傷寒論》。其中，外感病的傷寒部分稱為《傷寒論》，其他雜病(包括外科疾病和婦科疾病)的內容主要稱為《金匱要略》。這是因為《傷寒論》在歷史演變中已經壹分為二，所以無論是講《傷寒論》還是《金匱要略》，它們在中醫史上的傳承和作用是壹樣的，不能再壹分為二了。如果要說《傷寒論》和《金匱要略》的主要區別，那就是如上所述，《傷寒論》側重於外感引起的傷寒，《金匱要略》側重於雜病；張仲景在《傷寒論》中創立了六經辨證理論，在《金匱要略》中創立了臟腑辨證理論，至今仍發揮著重要作用。
如果要說《傷寒論》在傳承過程中的作用，那應該和《傷寒論》在中國醫學中的作用是壹致的:張中將經方和醫經融為壹爐，開創了理、法、方、藥(以理、治則、治法、方藥組成)合壹。這就是張仲景這本書的學術背景。他將漢代以前的醫典和經方融為壹爐，建立了理論、規律、方藥相結合的辨證論治體系，為中醫臨床醫學的發展奠定了基礎。