所謂配伍禁忌，是指某些藥物會產生或增強嚴重的毒副作用或降低或破壞藥效，故應避免，即《神農本草經》中所謂的“勿反用”。
由於藥物的藥性不同，其作用也各有特長，有壹定的適用範圍。因此，對於某壹類型或某壹疾病，應避免使用某壹類型或某壹藥物，這稱為證候用藥禁忌癥，也稱為疾病用藥禁忌癥。原則上，凡是不正確的藥物和藥物療效不是病情所要求的，而是可能導致病情加重、惡化或新的疾病，都屬於臨床禁忌癥的範圍。
妊娠期用藥禁忌癥是指婦女妊娠期用藥的禁忌癥。孕期用藥禁忌癥是指除中斷妊娠和引產外，婦女不能使用的藥物。孕期對孕婦和胎兒不安全、不利於優生優育的藥物為妊娠禁忌癥。
服藥時的飲食禁忌是指服藥期間對某些食物的禁忌，也稱食物禁忌，也就是俗稱的禁忌。