原因是:
1.這是建立秦專制政治制度的需要。
2.壹些儒生和遊民引用儒家經典，用古代聖賢的話批判時政(只為欺騙儒家，史學界至今仍有爭論。總的來說有三種觀點:第壹種認為歷史上不存在所謂焚書坑儒，純屬後人杜撰。民國時期興起的“疑古派”持這種觀點。近幾十年出土的文物有力地支持了司馬遷《史記》的真實性，從而證明疑古論不成立。第二是有些人確實被騙了，但他們只是煉金術士或魔術師。持這種觀點的人不了解術士的性格，把他們和方士混為壹談，因為他們沒有儒家經典的修養。古書《禮記》中有許多常見的偽字。雪姬說，“飛蛾撲火，可以借鑒”，手法的描述就是壹個例子。術士是講故事的人，古代的學者遵循孔子“信古，言不盡行”的信條，學會了講(學術)而沒有自己的創造(創作)。這也是“學術”壹詞的由來和本義；第三是秦始皇真的活埋了很多秦學術界、百家爭鳴的代表人物。
3.在關於郡縣制的爭論中，宰相李斯斥責了儒家按古制實行封建制的思想。