公元552年，梁元帝向日本贈送了壹套《針經》。公元562年，吳仁之從帶著屠和164卷醫書赴日本，開始了中日兩國直接的醫學交流。到了隋唐時期，中國從大壹統走向了繁榮，成為了亞洲的科技、經濟、文化、醫藥中心。中日之間的交流每月都變得越來越頻繁。公元608年，日本退谷天皇派遣藥師惠日和留學生知府尹來華學醫，歷時15年。628年回國，帶回大量隋唐醫書。公元754年，唐朝僧人鑒真應邀前往日本，帶去大量醫學書籍，促進了日本醫學的發展。此後，隋唐兩宋時期的大量醫學和醫學著作不斷傳入日本，成為日本醫學的主流。此外，當時的日本不僅在臨床上采用了中醫理論和辨證論治的方劑，而且在醫學著作、醫學體系、醫學教育、醫學管理等方面也與中國相同。如公元9世紀，日豐城的出雲廣真皇帝奉命編纂了100卷的《大同文》，是參考了傳入日本的《黃帝內經》、《黃帝針經》、《脈經》、《A-B經》、《小品方》等而成。10世紀，丹波康萊所著《藥心方》30卷，收錄南朝、隋唐醫書100余種。公元701年，日本武文天皇(第42代)大寶元年，頒布了大寶令，其中醫病令是以唐朝的醫療制度為基礎的。這部法律是日本最早的醫療制度。
所以可以說，從公元5世紀開始，日本的中醫就通過廣泛而頻繁的學術和人員交流不斷傳入，然後從學術、臨床、行政等方面簡單而忠實地模仿。這種趨勢壹直持續到15世紀，也正是因為這種實事求是、虛懷若谷的長期學習和應用，才為中醫在日本的獨立發展和形成體系奠定了堅實的基礎。
？公元15年底，田三喜(公元1465 ~公元1537)入明拜高僧月湖為師，專修金元醫學。12留學後，創辦李、朱醫學。當時日本社會盛行宋明理學，其弟子屈直舒三刀大力推廣，並創辦了啟蒙學院，教導弟子800多人。梨竹的藥逐漸傳遍日本，風靡壹時。
1571年，曲直瀨道三代表作《悟道集》問世，該書引用了中國63種醫書，以李東垣的脾胃學說、石蘭秘藏、朱丹溪的格致雲學說、丹溪心法為最多。但並不局限於金元時期的醫生，而是第壹次博采眾長，提出傳統醫學的理論來把握人體的生理、病理和疾病表現。在此基礎上，形成了較為完整的理論體系，奠定了中醫在日本獨立發展的基礎。
在屈直·奧特·三刀之後，有許多追隨者，他的大多數弟子都成了當時著名的醫生。江戶時代初期及此後約100年間，以金、元醫學三大無間道學派為主導，從而形成了日本第壹個中醫學派，即所謂的“後醫學學派”，真正開始了日本醫學在中國的階段。
？日本江戶時代(公元1603 ~ 1876)，由於社會思潮的變化和自然科學的進步，宋代儒學的影響力逐漸下降，掀起了壹場以伊藤仁齋為首的儒學復古運動，哲學實證主義取代了陰陽五行的思辨理性主義。宋代與儒學有著千絲萬縷聯系的金元醫學，顯然與當時發達的盲學不協調。此外，統治中國醫學界百余年的後世醫派，不僅堅持金元醫學的空論，而且在醫療上濫用溫補。這不可避免地在醫療領域掀起了壹股復古風潮。
？其代表人物有:湘川安秀、谷乙冬(公元1702-1773)等。他們認為古代醫學是從純粹的觀察和實踐經驗中總結出來的，在臨床上是最有價值的。他們把貫穿陰陽五行學說的《內經》醫學視為陰陽醫學，把沾染道家思想、追求長生不老的《神農本草》醫學視為神仙醫學。他們認為不能和張仲景的醫學相提並論，所以推崇《傷寒論》，並將其發揚光大。
？正是在這種古而實證的思想指導下，古代學派的學術體系建立在《傷寒論》的基礎上。特別是古文學派的主要代表人物紀堯東的《雷菊芳》、《鄭堯》等著作，有選擇地吸收了《傷寒論》的精華，並結合自身的經驗，使古文學派的發展達到了頂峰。此外，由於《傷寒論》中“腹診”較為常見，東東也大力提倡，並使之具體化。東東的理論既呼應了當時的社會和醫學背景，又迎合了日本註重樸素實用的民族心理性格，因此大受歡迎，很快壓倒了輿論，成為中醫的主流，至今從未失敗。
？江戶中期，古學派與後學派對立，學術爭鳴十分活躍，使中醫學迅速發展，形成了自己的學術特色和明顯的學派傾向。理論上，《傷寒論》是基本框架，高度簡化。臨床上註意方證對應；強調腹部診斷在診斷中的重要性；處方是處方的單位。最終實現了日本醫學在中國的進程，誕生了名副其實的日本傳統醫學——中醫或東方醫學。
幾乎與此同時，西醫傳入日本，但真正受到重視的是在17世紀，荷蘭人進入日本之後。公元1754年，京城醫官山脅東洋(Toyo Yamawaki)根據西醫的解剖學，對古代醫書的錯誤進行了修正，寫成了《臧智》壹書，是日本近代解剖學的開山之箭，引起了壹些中醫的註意和研究興趣。
隨後，有關西醫的解剖學、生理學、臨床學科和藥學的書籍不斷問世，使得只有醫生廣泛接觸西醫理論，發現其可取之處，逐漸接受西醫，並試圖將中西醫結合起來建立新的醫學體系，從而形成了歷史上的“中國-蘭州醫學折衷派”。
折衷派吸收了後世方派和古方派的優點，揚棄了它們的缺點，又吸收了壹些西醫的觀點來論證臨床上無論哪壹派都是有效的，都應該選擇哪壹派。中醫麻藥的發展，世界上最早成功切除乳腺癌的華鋼青州和永福杜曉寺，以及明治初期稱霸中國邊境、號稱幕末明治的漢巨淺田宗博，都可以說是不拘壹格的代表。
但在德川幕府末代，傳統醫學學科從折衷派中分離出來，出現了考據派，並取得了主導地位。他們把中醫經典著作的研究推向了壹個新的高潮，代表人物是山田正德和丹波家族。此後，到19世紀中葉，日本中醫的古學派和折衷派影響很大。前者強調“經驗實證主義”，重視臨床經驗而輕視理論。在折衷派中，考據派是主流，側重於古代文獻的考證、訓詁和註釋。理論上尊古，沒有原創思想，導致中醫和外科割裂，極大影響了醫術教學。
到明治之前的幕府末期，名醫寥寥無幾，醫學教學中的保守主義和神秘主義引起了當時民眾的反感和不滿。此外，中醫與發展戰傷外科、預防醫學、群體治療醫學、防疫醫學等“群體預防醫學”的需要相矛盾，使中醫在與西醫的競爭中處於劣勢。
？1868年，日本政府進入明治時期；打破德川幕府200多年的閉關鎖國政策，實行富民強兵政策的同時，在傾向西方文化的社會大潮背景下，醫學也轉向了西醫。韓方醫學院被關閉，領導權由西醫掌握，片面強調西醫的優勢，忽視兩種醫學的區別。它大力提倡西醫，采用西醫分家制。通過西歐的醫學教育，培養了大量的西醫，中醫在此時陷入低谷。明治八年後，中醫甚至處於法律上的不可能狀態。至此，中醫進入了歷史上最艱難的階段。
從明治8年開始，當時以復興中醫為目標的醫學工作者聚集在壹起，為中醫的生存開展活動。在過去的20年裏，中醫進行了三次鬥爭。從明治8年到16年的八年間，進行了壹場理論鬥爭。針對外國醫學七科政府考試的醫療制度改革方案，以淺田宗博為首的六賢聚集研究，提出了中醫考試六科(開物、講理、臟腑經絡、探理、多邪機理、藥體運用、脈病診治)的修訂方案，並加以關聯、公布、執行。
鬥爭的大本營是東京的文治社，主持人是山田博之、淺田宗博、國幹淺井等中醫代表。到明治15年，文治社召開第三次全國代表大會，文誌和贊育(京都春雨(熊本)實行西方七科考試制度，醫療制度的滲透會取消中醫的措施。
此後，中醫雖然自明治17~20以來壹直在爭取治療，自明治23~28以來壹直在議會鬥爭，但壹直持續到最後才站住腳。但由於政府和洋醫生的打壓，中醫已經面臨著森利智、青川玄道、淺田宗博等核心人物的死亡。
特別是在明治28年的第八次國會上，中國醫生提出的修正法案僅以27票之差被否決，至此，中國人的生存運動宣告失敗。中外醫生的鬥爭史，以淺井國先人之死而告終，中國醫生壹敗塗地，逐漸衰落。
1906以後，尤其是第壹次世界大戰(1914)以後，日本出現了重新評價中醫的局面。第二屆日本聯合醫學會於65438年至0906年在東京舉行。東大的三浦·金之助教授和山下俊壹郎分別就針灸治療和中醫的價值做了報告，在醫學界引起了極大的震動，讓很多學者不得不反思過去“中醫方劑低級無用論”的正確性。
1910年，韓、田啟士郎自費首次出版了《醫界的鐵脊椎骨》，用自己的臨床實踐闡述了中醫的價值。這本書是壹個非常有效的運動。此後，壹些具有相當造詣和地位的現代醫學專家，如大政府時期的阿薩希娜·泰妍；在昭和時期，友本和伊藤雅治在實踐中認識到了中醫的未來，並投身於這項艱難的事業。由於他們的知識和聲望，他們對堅持和復興中醫有很大的影響。
尤其是Tommoto撰寫的《黃菡醫學》三卷本，第壹次結合西方醫學知識闡釋了漢漢醫學，成為推動中醫復興的巨大力量。此外，還有壹些漢醫世家的後代取得了西醫資格。他們誌願跟隨中醫，刻苦鉆研中醫，潛心積累臨床經驗，努力提高中醫臨床療效，以求站穩腳跟，擴大陣地。如矢、安西安州、木村昌九、野史郎、清水太郎、劉、顧素齡等。，都成了中醫復興和發展的奠基者。
第二次世界大戰後，德國和法國也開始研究東方醫學的針灸。所有去過德國和法國的日本醫生都必須被問及關於東方醫學的問題。這個事實讓現代的日本醫生感到驚訝，讓他們意識到那些醫生應該重新認識東方醫學。此外，日本醫生對現代醫學中的新藥和化學藥品的副作用感到失望，自然將目光轉向東方醫學。
東方醫學使用的天然生藥復方，如果按照規定使用，可以說沒有化學藥品那樣的副作用。醫學界需要的是能導致對人的體質產生全面治療作用的藥物，哪怕它的作用有點慢。中藥裏有符合這種希望的原料。曾經被嘲笑為東方醫學弱點的東西突然再現為強項。因為自身的特點，東方醫學開始了新的復興。
1950年，分散在全國各地的原“東亞醫學會”成員，在明道安史和板倉武的積極策劃下，註冊成立了“日本東方醫學會”。並在非常困難的情況下，召開了東方醫學會第壹次學術會員大會。隨後又恢復了戰前的中醫刊物《韓方與韓瑤》。
1954年，由發起，聯合野史郎、中村義夫、森田、麻昌賢治等幾位當時的中國名人，創辦了《韓方臨床》雜誌，取代了原來的《韓方中醫》。在創辦中遇到各種困難，在連續三年赤字的情況下，每個人每個月都拿出自己的收入來支付雜誌的虧損。為了中國事業的生存和發展，它付出了巨大的代價。
到了20世紀70年代，在國際“中醫熱”的影響下，通過日本華人社團的努力，華人事業有了很大發展，出現了壹派繁榮景象。其主要表現如下:
？？(1)社會地位的提高。20世紀70年代，中國醫療在日本社會享有很高的聲譽。與西醫相比，東方醫學的許多優勢已被人們所認識。中醫不僅廣泛應用於民間信仰和應用，也廣泛應用於各級政府和機構。就連醫學院校的學生也害怕化學藥物的副作用，生病時使用中藥制劑。因此，中醫藥在社會醫療中的作用引起了各界人士的關註。日本自民黨成立華人聯盟研究會，由中曾根首相擔任名譽會長，各大社會活動均有華人社團代表參與。對中醫做出突出貢獻的中國醫生被授予了很高的榮譽。在全日本醫學協會設立的第32屆和第33屆紀念醫學會議上，醫師會會長武太郎分別向中村義夫和武市義夫頒發了“最高功勛獎”。
在上世紀70年代中藥方劑復興的高潮中，為了順應民心，1976年，厚生省正式將中藥方劑制劑納入“藥品價格基準”，開始是43種，1981年增加到613種。將主要的中國處方制劑指定為在全國通用的保險制劑，並建立健康保險機構，以便在華人社區中不斷向機構輸入保險費。從而使華人事業在日本的發展有了強大的資本。
從65438年到0972年，建立了以北理所附屬東方醫學會綜合研究所為首的壹系列中國醫學研究機構。在世界著名的現代醫學研究機構北理所設立東方醫學研究年，無異於公開支持中醫的存在，承認其在現代醫學最高學術領域的真實未來。其影響的深度和廣度是非常大的。不僅實現了半個多世紀的中醫夢，而且迅速帶動了壹批先進的專業研究機構的建立，形成了研究體系。出現了前所未有的學術研究氛圍，學術水平迅速提高。1979年，國家科學技術部制定了中國醫學研究綜合計劃，投入100億日元研究證候經絡實質、血瘀、藥材資源保障。為中醫的快速發展奠定了基礎。
(4)學術活動越來越活躍。日本東方醫學會、各地東方醫學分會和各種華人組織也在不斷組織各種學術交流。很多中醫名醫經常舉辦學術報告會，做很多座位，積極傳播中醫知識和經驗，讓中醫更受歡迎，甚至家喻戶曉。在日本社會形成了壹定的聲勢。至此，每壹個中醫都全面復活了。