正常工作情況下，檔案館主要接收文書部門和業務部門根據歸檔要求設置的檔案，檔案館主要接收辦公室檔案館根據入館要求移交的檔案。這樣，檔案室和檔案室的歸檔工作主要是在更大的範圍內對接收的檔案進行進壹步的系統整理，如全宗和檔案的整理，檔案目錄的加工等等。
2.局部調整
對已整理入庫並留在室內的檔案，經管理實踐檢驗或專項質量檢查後，檔案館、檔案室需對不符合要求的檔案進行處理，以提高其質量；另壹方面，有些檔案材料因為保存時間的原因發生了變化，必須進行整理。
3、整理的全過程
檔案館、檔案室有時會接收和收集壹些零散的檔案，這就需要對檔案進行整理的全過程，包括對所有案件的檔案進行分類、分組、立卷、編號、編檔目錄和系統排出。
整理工序
1.折疊整理按照壹定的原則對檔案實體進行系統的分類、組合、排列、編號和基本編目，使之有序的過程。
2.折疊來源原則:將同壹機構、組織或個人形成的檔案作為壹個整體進行管理的原則。
3.折疊文件實體的分類:根據文件實體的來源、形成時間、內容和形式對其進行分類。
4.折疊歸檔單位:構成檔案的國家機關、社會團體或個人。
5.將所有案件折疊合並:由兩個或兩個以上的歸檔單元形成的相互聯系的卷宗，不易區分所有案件，而是作為壹個整體卷宗處理。
6.所有案件的折疊集合:由幾個小案件組成的案卷，案卷數量很少，具有某種* * *特征或聯系，作為壹個整體案件處理。
7.折疊全氏族群:由幾個具有相同時間、地域、自然特征的全氏族組成的群體。
8.折疊文件:許多相互關聯的基於記錄組的文件存儲單元。
9.折疊歸檔:將幾份文件按照形成規律和有機聯系組合成文件的過程。
10.卷內折疊參考表:卷內文件狀態的記錄單，排列在卷內文件之後。
11.折疊文件號:以字符形式給予文件實體的壹組代碼，用以固定和反映文件的排列順序。