“腎為氣之根”，《辨證論治》言:“肺主氣，腎為氣之根。肺主氣，腎主氣。”“腎為氣之根”是指腎為人體之氣之根。從《類比與證治》原文來看，“腎為氣之根”的意思是“肺為氣之主”，然後又說“肺為氣之主，腎為氣之主”。結合上下文可以看出，“腎為氣之根”強調腎在呼吸運動中的作用。可見，“腎為氣之根”和“腎主氣”在不同的語言中是同義的，即腎為氣之根，具有吸收呼吸之氣，保持呼吸深度，防止呼吸淺化的作用。所以辨證論治說:“肺為氣之主，腎為氣之根。肺主出氣，腎主納氣。陰陽相交，呼吸為和。”
呼吸運動雖以肺為主，但也與其他臟腑相關。人體呼吸的正常運動依賴於肺氣的釋放、腎氣的吸收、心氣的提升和肝氣的通暢調節。所以，很難。四難:“呼出心肺，吸入腎肝。”因為腎藏精，是“封藏之本”(《蘇文》)。六藏相論)，腎(命門)為“十二經脈之根，呼吸之門，三焦之源”(王肯堂《靈蘭姚瀾》)，而腎經陰虛“其直從腎穿肝膈入肺”(靈樞)。經絡”)，“腎接肺”(《靈樞》)。所以腎的封閉功能可以吸收肺部吸入的天然清氣，從而使呼吸均勻、深沈、有力。正如《醫理》所說:“氣本於腎，亦屬腎。故腎之氣，息之深也。“肺在上焦，則呼吸；腎在下焦，則吸氣；當肺腎合壹時，它深呼吸，節奏均勻。
腎主氣以腎藏精為基礎，是腎的封閉功能在呼吸運動中的體現。因此，明代李倩在《醫學概論》中說:“人有兩個腎，...這是密封的基礎。”如果腎精充足，氣的攝入正常，呼吸深長有力；如果腎精不足，腎氣虧虛，吸收無力，既不能吸收肺在自然界吸入的清氣，又不能調節呼吸的深淺，導致呼吸浮淺，呼吸過度，動則氣喘，呼吸衰竭。也就是像《靈樞》壹樣。經絡說:“腎足缺陰之脈，謂動則病饑，面如漆木。咳吐時有血，飲時有喘息。”《辨證論治規範》雲:“腎氣沖則真元衰，……氣不歸元。”
腎為氣之本的理論對臨床疾病的診治具有重要意義。由於腎為氣之根，慢性咳喘常傷腎，即如《臨床醫案指南》所言，哮鳴“實在肺，虛在腎”。《證治規範》也說:“肺虛則氣短，久病則肺腎俱虛。或者要傷腎，精氣從妳身上帶走，根本不固，使妳的氣失進，出多入少，逆著妳的氣沖上去喘氣。”因此，在臨床上，慢性支氣管炎、喘息性支氣管炎、哮喘等疾病初期多從肺論治，久治不愈者多從腎論治，補腎平喘法往往有效。