就在毛立誌報國之際，東北建州女真族崛起，其首領努爾哈赤於1616年在赫圖阿拉建立後金政權，自稱可汗，建立了袁的“定數”。
兩年後，努爾哈赤以“七大恨”為借口討伐明朝。壹時間，遼東地區戰火紛飛。當時明朝朝廷的權力由壹群宦官把持，他們愚昧無知，結交漢奸，排斥異己，導致明朝國運衰敗。受此影響，明軍戰鬥力低下，幾乎沒有還手之力。
在後金軍隊的猛攻下，明軍全軍覆沒，明軍戰敗的消息不斷傳來，震驚朝廷內外。毛對也很著急。跟隨大學士孫承宗，監視遼東地區明軍的戰備和作戰情況。他還與同僚盧善姬、袁崇煥、孫壹起，考察山海關內外地形，研究敵情，協助孫承宗作戰，抵禦後金進攻，並在江南籌戰船，以加強遼東海軍，提高明軍戰鬥力。
在孫承宗的指揮下，明軍收復遼東地區九城城堡45座，毛因功績卓著被推薦為國子監。
面對明朝松弛的軍事裝備，毛急怒之下，下大力氣著書立說，刻苦鉆研歷代兵法理論，通過多年的搜集整理出治國平天下之策。鑒於這本書的主要內容和寫作目的，毛把這本書命名為《吳備之》。
武備誌是壹本綜合性的軍事書籍。這種綜合性的兵法刻於天啟元年，即1621。從此，這位年輕的學生名聲大振，以知兵之名傳遍各地。
毛是文武雙全。當時人們這樣稱呼他:“我年輕的時候，生在西方，成名在北方。下幕名為秀才，馬為將軍。”他壹生著述甚多，有《吳備之》、《武將略》、《傅僚邊宇》、《石民不平集》、《閑舊村雜記》、《野航史》等60余種、上百萬字，其中《吳備之》是對後世影響最大的著作。《武北誌》共分240卷，200多萬字，738幅圖。全書由軍事戰術評估、戰略考試、陣法訓練體系、軍事資本倍增、占領五部分組成。
《冰覺評論》第18卷收錄了《吳京》七部，並對《太白靜音》和《虎仲景》的部分內容進行了選編和評論。在這壹卷中，毛袁遺對《孫子兵法》的評論是最多的，可見《孫子兵法》的重要性。他認為學習兵法必須讀書，說:
先秦時期有六大兵家，前有孫，孫不留後，後有孫不能留孫。據說這五個人能夠照顧他們的孫子。
《戰略考》共33卷，按時間順序排列，從戰略角度選取了600多個春秋至元代有參考價值的戰爭實例。所選戰例註重奇詭，如，吳越之霸，勾踐之役勇，虛隙取利；馬嶺之戰，孫臏以減竈引敵埋伏示弱；赤壁之戰，孫劉連聯合打敗曹，巧用火攻等等。大部分記錄的戰鬥都是靠著極大的聰明才智贏得的，並且在關鍵點上做了評論。
陣列訓練系統41卷，分為陣列訓練和訓練兩部分。陣法部分記錄了西周到明朝的各種陣法，365，438+09陣法，以諸葛亮的八陣法，李靖的六花陣法，戚繼光的鴛鴦陣法為細節。陣列有記敘文和辯證法。
訓練部分詳細記載了選兵練兵的方法，包括選兵、編武、掛令、獎罰、教旗、教術五個方面，選兵練兵的方法詳細記載了選兵淘汰、編車、步、騎、北兵的武學、獎罰法、教兵法、兵器訓練。其內容多來自軍事書籍，如《太白靜音》、《虎鈴經》、《行軍須知》、《紀律與效能新書》、《訓練實用紀律》。
毛認為古陣法失傳，後人杜撰，以致以訛傳訛。他畫這些圖是為了追根溯源，傳播真正的陣法。
軍事資產共55卷，分為營、戰、攻、防、水、火、餉、馬八大類。細節共65項，內容廣泛，包括行軍宿營、作戰部署、河海運輸、軍艦馬匹、屯田開礦、提供口糧、人馬醫療等。
這些內容都有詳細的記載，比如600種攻防器械、戰車、船只、各種武器等。其中火器180余種，包括陸戰、水戰、飛鏢、水雷等使用的火器。記載非常詳細，這是其他軍事書籍無法企及的。
會計93卷，分為會計和會計兩部分。占天，主要記載天文氣象，包括占天、太陽、月亮、星象、雲、風雨、風、霧、紅霓、輝光、雨雹、五行。這部分內容是把自然和人事聯系起來，認為某種天象往往是某種人事即將發生的征兆。
度即程度，主要記錄士兵的地理面貌，分為地理、鎮防、海防、防長江、四夷、航海六大類。它描述了地理形勢、通關的危險、陸海敵情、禁衛軍的部署、總督的監管、帶兵的數量、士兵的富裕程度等等。
作為百科全書式的兵法，吳備之體系宏大，組織清晰，體例統壹。它將2000多種各朝代的軍事著作進行了分類，每壹類都有前言，對其源流進行了考察，對其內容進行了概括，並說明了編纂的指導思想和資料依據。
毛袁遺在每個類別下又分為若幹子類別，在子類別下根據需要設置明細。文中有註釋解釋疑難典故，用各種符號和文字表達對各種問題的看法。
這本書有明朝最詳細的軍事記錄。毛不僅記錄了戚繼光、等人治軍、練兵、作戰的言行，而且還選錄了他同時代人的軍事資料，如王的《號令論》。
毛在《軍事準備》壹書中表達了加強軍備、充實強兵的思想。他痛斥當時的士大夫不重視軍事，壹旦發生戰爭，他們驚慌失措，束手無策。他提出:“只有富人才能造就強兵”，這也是本書的主題。他說服朝廷重振軍事裝備，提高警惕。
他還主張開礦、開荒、發展經濟，軍隊要勤練，認為:“兵者有練，聖人有六藝。”不練就當眉毛了。“在國防上，他主張邊防、海防、河防並重，不可偏頗，給敵人可乘之機。
《武北之》整理了許多其他古籍中很少記載的珍貴資料，如壹些雜陣陣法、陣法，專門研究陣法、陣法的著作中沒有記載，如《武經續概論》，但在《武北之》中有詳細記載。
《武備誌》的出版和傳播，對於改變晚明重文輕武、武將不懂兵法而棄兵器械的局面，具有重要的現實意義。它種類繁多，收藏全面，其中儲存了許多非常珍貴的資料，為後人所推崇。