溫病學理論的發展和形成主要分為四個階段，每個階段的主要特點如下:
1，萌芽階段(戰國至晉唐)。代表作有《黃帝內經》和《傷寒論》，黃帝內經第壹次提出了傷寒的名稱。《傷寒論》的清熱攻陰等內容也是後世傷寒治療學的重要組成部分。
2.成長階段(宋金元)。許多醫家最終認識到用《傷寒論》經方治療外感發熱已不能滿足臨床需要，並提出了改革發展的思路。
3.形成階段(明清)。作者在總結和繼承前人溫病理論和經驗的基礎上，結合自己的實踐和經驗，對溫病的諸多領域進行了開拓性的深入研究，編纂了大量的溫病專著。
4.溫病學的發展完善階段(建國前後)。溫病學得到進壹步發展和完善，出現了張錫純、吳、丁甘仁、何等壹大批名醫。
原因
首先，由於明清時期城市的發展和人口的集中，疫病成為當時醫學界面臨的新問題。據相關文獻統計，明代276年共發生64次疫情，清代266年共發生74次疫情。
如明朝永樂六年，江西建昌、浙江杭州、福建建寧、邵武等地死亡78400余人。由於傷寒的傳統法治並不理想，當時的醫生不得不尋找新的方法來治療這些瘟疫，這為傷寒學說的出現創造了積極的條件。
此外，溫病學起源於中國南方，也與中國南方特殊的地理環境有關。我國南方，尤其是江南的湖泊河流，地處低濕，水資源豐富，壹年四季氣候分明，比北方溫暖，這也造成了江南溫病的自然條件。
這也給了江南醫家更多治療溫病的實踐機會，這也是溫病學派在中國南方尤其是江南產生的重要原因。