自然療法之父格爾森在治療癌癥患者時，為癌癥患者提供大量的果蔬汁。這些果蔬汁的解毒作用，使患者血液中充滿了肝臟無法及時排除的毒素。因此，格爾森每天用咖啡灌腸5~6次，幫助肝臟排毒，以緩解大量毒素排入血液而產生的困倦感。在1981中，Waldenberg博士科學地證明了咖啡中所含的成分可以幫助酶分解血液中的毒素，重新肯定了傳統咖啡灌腸方法的有效性。
日本醫生Hiromi Shinya以其30年的經驗和對研究資料的參考，為他的病人和讀者倡導咖啡灌腸。宋美齡女士堅持腸道排毒，直到106歲。越來越多的人了解到咖啡灌腸的好處，而隨著網絡信息的發展，這種保健方式也逐漸被國人接受和使用。
但是在民間推廣的過程中發現了幾個嚴重的問題，會讓健康的咖啡灌腸變成健康殺手。我們必須提醒每個人:
首先，有機咖啡不健康
越來越多的證據證明，使用傳統工藝生產的有機咖啡，容易留下農藥和化肥。這並不是說有機咖啡是用農藥化肥生產的，而是在目前的生產環境和技術下，即使符合有機標準，仍然會有壹點化學成分。這種小成分用在腸道裏，很容易形成很大的風險。中國生產的有機咖啡，以及硝酸鹽超標的問題，會讓建議使用咖啡灌腸的自然醫學醫生不敢貿然使用。
第二，過多的灌腸傷害了陽氣。
灌腸是中醫領域的壹種導瀉(傷寒論裏的豬膽汁方子也是壹種灌腸)，所有導瀉方式都很少傷害到楊琪。所以壹定要適度，因人而異，適合不同疾病、不同體質的灌腸次數和頻率也不壹樣。目前很多人第壹次灌腸後感覺很輕松，很容易形成壹種癮，但不知不覺中已經傷害到了陽氣，陽虛的危害眾所周知，已經不用多說什麽了。
第三，烘焙和儲存方法不對
咖啡灌腸的使用壹定要用輕度烘焙的咖啡，壹般賣的咖啡粉都是重度烘焙的咖啡豆(並且已經磨成粉)。正確的做法是購買生咖啡豆，使用時采用輕烘焙，放置兩三天後研磨待用。烘豆壹周內用完，超過壹周還有保存失敗和保存汙染的顧慮。