李博覽群書之後，年輕時參加科舉考試，但後來因為父母被雍藥殺死的痛苦和早年的病痛，轉而學醫。學生非常重視中醫理論研究，博采眾長。他對醫學理論的討論可能相當簡單。所寫的書大多通俗易懂，是初學者進入課堂的最短路徑，堪稱當時最全的壹套中醫教材。因此在吳中醫界廣為傳誦，成為明清時期江南大醫大師，為中醫的普及做出了巨大貢獻。
其成果有:《內經要義》、《藥性解說》、《醫案10》、《外感熱病2》、《本草宣彤》2、《病機殺傳》2、《診斷學》2、《益生理中》4。1667年共同出版的《診斷家目》、《本草宣彤》、《病機痧傳》三本書，被稱為學者三書。《李仲子醫案》收錄醫案50余篇，不分類別、稱謂，多為內科雜病疑難雜癥。從書中可以看出，李擅長脈診辨證，方藥靈活，病例語言清晰。壹開始沒有發表，後來收錄在李彥g的《脈訣集解》裏。
醫學教育的著名弟子
李的弟子多為吳中醫家，其中以沈朗中、、蔣世濟尤等最為傑出。至於的弟子，還有葉，尤其是在正道上。壹是他對溫病學的建立做出了貢獻，二是他對仲景經典進行了有效的闡發，使吳中醫學得到了進壹步的發展。
學習方式
李的治學，博采眾長，並不偏執。他非常重視陰陽、水火的關系。認為陰陽水火是萬物之本，在人體內就是氣血。水火不可分，水火的盛衰與不動促進了萬物的生長發育。在火、水、陰的關系中，陰根源於陽，陽根源於陰，但無論陰陽，陽在生命活動中尤為重要。既然陽對人體如此重要，因此，氣血兩虛、陰陽兩虛者，應先補氣血，並提出“氣血並重，先補氣後補血；陰陽都需要，養陽在養陰之上。李的重陽思想與的重陽思想有許多相似之處。張重，主張溫補腎陽；李重益氣補陽。正是因為李重視兩天，所以他的臨床實踐從脾腎入手，重視兩天的調理。常用於治療內傷雜病，如補中益氣湯、四君子湯、附子理中湯、六味地黃丸、金匱腎氣丸等。
李仲子在臟腑辨證中特別重視脾腎，他在《醫宗必讀》中論述了"腎為先天之本，脾為後天之本"的命題，對後世影響很大。
醫學理論李鐘子認為，求治之根，就是掌握生命之根。人生的基礎無非是先天的基礎和後天的基礎。先天之本在腎。“腎為臟腑之源，十二脈之根，呼吸之源，三焦之源，人力資源為始。”腎精充盈，臟腑精氣充足。而元氣是壹切氣的基礎。無論臟腑之氣還是經絡之氣，都根植於元氣。因此，為了挽救生命，我們必須保護先天腎臟中的精氣。同時後天的脾胃也很重要。他說:“妳出錢，就分了。胃氣衰，百藥難施。妳壹有了這個身體，就被賦予了五谷之氣，五谷之氣會進入胃中，灑在六腑上而得氣，調至五臟而生血，而人力資源認為活人也。所以，後天之本，在於脾。”其基本思想與李東垣認為脾胃是元氣之本的認識是壹致的。人在成長的過程中，總是依賴於水谷之氣的不斷滋養，而五臟六腑也只有在水谷之氣的不斷滋養下才能發揮其功能。水谷之氣的化生有賴於脾胃，所以脾在人體生命活動過程中非常重要。
由於脾腎在人體生命活動過程中非常重要，李在診療中非常重視對二日虧損的治療。認為脈診法應強調胃、神、根。胃氣和腎氣的盛衰，確實是人的生命之本。所以脈診要註意胃氣和腎氣的升降，這確實是診斷的最關鍵點。在治療方面，李仲子接受了李東垣、趙先科和薛吉的理論，從脾腎兩臟入手。所以他在《醫者必讀之教義，腎為先天之本，脾為後天之本》中說:“治先天之本，有水火之別。如果水分不足，要用六味丸加強火候來控制日照；如果火不足，用八味丸益火之源，以消陰。後天治療的話，就分吃疲勞了。如果妳吃東西受傷了，支竹藥丸會幫妳解決。累傷，補中益氣湯為主。”六味、八味方是趙賢能善用的補腎生津之藥，支竹丸、補中益氣湯是李東垣健脾和胃的奇藥。薛派兩派齊天平地，李非常推崇。因此，他說，“妳每次去齋治病，就應該多用前面的。不知道的人會討論它的偏頗，但妳要明確求根，才可以壹窺李宅。”所以他治療薛氏病以六味、八味、枳實、補中為主，療效顯著。
李仲子治療脾腎並重，可以說是前人治療虛證理論和經驗的集大成者。其學術壹傳於沈朗中，壹傳於，三傳於景，均為明清之際頗有影響的醫家，這與李學術的影響不無關系。
人物評價李仲子在醫療上註重脾腎管理。江蘇金壇有個名醫王裕泰，80歲了，脾瀉。按照壹般醫學理論，腹瀉是要補的，但是越補病情越嚴重。他向仲子求教。仲子問清病源後對他說:“妳胖，痰多，越補越滯。當然，妳的病不會好的。妳要違背它的常規，用速效藥洗。”王聽了，稱贊說:“世上只有妳和我是醫生。妳開藥方，我吃藥。有什麽疑問！”仲子用巴豆膏給老醫生，果然流了很多痰，痊愈了。
他註重實踐，從不墨守成規，在實踐中總結經驗，對各種疑難雜癥頗有研究，在當時被稱為神醫。有壹個人叫陸帆，他患了壹種奇怪的疾病。夏天的壹個大熱天，雖然門窗緊閉，床上掛著窗簾，身上蓋著三床貂皮被子，他還是不停地喊冷。觀察病情後，李忠子被診斷為“發燒”。古人用“冷水灌法”治療，仲子略加改動，改服石膏三胡湯。他開了三片藥，第壹片吃了，病人拆了貂皮被子；吃完第二帖，病人把簾子撤了；吃了第三貼，病人要求打開門窗，才發現他汗流浹背，熱氣騰騰，他的毛病都治好了。還有壹個叫居的人，得了壹種怪病。發病時，他伴有高燒。在胡言亂語中，他能說出戶外發生的事。經過反復試驗，經李忠子觀察，確診為“遊魂”病。敷後高熱消退，譫妄停止，意識狀態恢復，後期癥狀消失。