巴黎大學創立初期，校內行政管理具有較濃厚的民主氣氛。學生和教師之間都是相當民主的，享有同等權利，並***同選舉大學校長。學校由校長領導，不受任何上級管轄。這種大學自治的特點，恰恰表現了它是城市市民反抗封建教會鬥爭的產物。