二是兩者產生的法律後果不同。撤回執行申請，當事人的實體權利不受影響，僅僅是本次執行程序不再繼續進行，申請人有權再申請執行。而撤銷執行申請，則意味著當事人對生效法律文書確定的權利予以放棄，法院將終結執行生效法律文書的執行。
三是兩者裁定的內容不同。撤回申請的，法院應裁定準許申請人撤回執行申請，並告知當事人有權再次申請執行；撤銷執行申請的，直接裁定本案終結執行。需要註意的是，許多省市法院提出了“終結本次執行程序”和“銷案”,這兩個概念都是申請人撤回執行申請的衍生概念。對於“終結本次執行程序”，其前提條件是被執行人長期外出下落不明，且無財產可供執行。當被執行人具備執行條件時，申請執行人可隨時向法院申請執行（剩余）債權。對於“銷案”，其前提是出於申請人的自願，且申請理由合法，在裁定準許申請人撤回執行申請時，必須告知申請人在簽收準許撤回申請裁定書之日起兩年內可重新申請執行，逾期不申請執行，視為放棄該項權利。
法律依據：
《中華人民***和國民事訴訟法》
第二百五十七條第(壹)項規定，申請人撤銷申請的，人民法院裁定終結執行。
《最高人民法院關於適用〈中華人民***和國民事訴訟法〉的解釋》
第四百六十六條規定，申請執行人與被執行人達成和解協議後請求中止執行或者撤回執行申請的，人民法院可以裁定中止執行或者終結執行。第五百二十條規定，因撤銷申請而終結執行後，當事人在民事訴訟法第二百三十九條規定的申請執行時效期間內再次申請執行的，人民法院應當受理。