主要研究領域為漢語方言學、地理語言學、社會語言學。
已出版《漢語方言地圖集》（主編）、《南部吳語語音研究》、《嚴州方言研究》、《吳語處衢方言研究》（合作）、《金華方言詞典》、《走過田野——壹位方言學者的田野調查筆記》等著作，在《中國語文》、《方言》、《語言教學與研究》、《中國語學》等國內外學術刊物上發表論文100余篇。研究成果曾獲得高等學校科學研究優秀成果獎（人文社會科學）壹等獎、北京市哲學社會科學優秀成果獎壹等獎、中國出版政府獎圖書獎提名獎、中國社會科學院青年語言學家獎、北京大學王力語言學獎等。其中《漢語方言地圖集》是世界上第壹部在統壹的實地調查的基礎上編寫的、全面反映20世紀漢語方言基本面貌的原創性語言特征地圖集。
目前正致力於《漢語方言地圖集》的後續研究和“中國方言文化典藏”項目的研究工作。
代表性著作
1.《漢語方言地圖集·語音卷》（主編），商務印書館，2008年
2.《漢語方言地圖集·詞匯卷》（主編），商務印書館，2008年
3.《漢語方言地圖集·語法卷》（主編），商務印書館，2008年
4.《南部吳語語音研究》，商務印書館，2002年
5.《走過田野——壹位方言學者的田野調查筆記》，商務印書館，2010年
6.《曹誌耘語言學論文集》，北京語言大學出版社，2012年