司令員是軍隊高級建制單位的軍事主官。
在我軍，司令和司令員沒什麽區別，不過司令員是正式稱謂。軍、兵種、武警總部、大軍區、省軍區、軍分區、衛戍區、警備區、海軍艦隊、軍區空軍和各基地的軍事主官稱作司令員。
2012年（壬辰年）10月28日各省武警總隊總隊長統壹改稱為：司令員。
其它國家軍隊沒有司令員的叫法，壹般都稱呼司令。
司令員是規範的稱呼；司令是口語，不規範，特別是在行文或著書時不應使用“司令”。但兩種叫法的都是指某部隊的最高軍事指揮官。
司令的起源：
中國古代就有“司令”之官。但和現在的司令風馬牛不相及，不是軍隊的高級指揮官，而多為掌管宮廷某項事務的壹種職官。
隋朝設有司令壹職，為內官。據《北史·後妃傳序》載：“司令三人，掌圖籍法式，糾察宣奏。”金朝時司令為典衛司、宮苑司、惠民司等機構的長官，主管本局、司事務，品秩為從六品至正七品。