進入新世紀以來，昆陽第二小學確立了“科學建校、特色建校、邁向教育現代化”的工作思路，不斷轉變教學觀念，改進教學方法，充分利用現代教育技術深化教學改革。1999年3月，學校成為浙江教育學院英語教育實驗學校，開展英語教育小班化實驗，成效顯著。2006年3月，被浙江報業總社命名為小學英語教育實驗基地。從2002年9月開始，學校圍繞省重點研究課題“現代信息技術條件下的開放式教學研究”及其10子課題開展實踐研究。在本課題的研究過程中，學校實行了全員電子備課，實現了分工協作和資源共享，全面提升了教師的信息技術水平，優化了師資隊伍。2006年5月，學校成為中央電化教育館“十壹五”教育技術重點研究課題的實驗學校，開展了小學漢字輸入與識字教學壹體化的有效性研究。學校投入200多萬元配置現代教育技術設備，形成了以信息中心、計算機網絡教室、電子備課室、校園辦公網、課堂小媒體平臺為基本框架的校園網絡系統，優化了學校的教育環境，實現了教學時空和教學管理的開放，贏得了良好的聲譽。
這所學校非常重視向學生灌輸傳統文化。古詩詞經典誦讀、相聲小品大賽、中國戲曲進校園、校園綠色童謠節等活動營造了良好的校園文化氛圍，取得了良好的效果(《五月端陽》集體誦讀獲浙江省經典美式英語誦讀電視大賽壹等獎)，全面提升了學生的文學素養和校園文化品位。