1，“機制”是指有機體的結構、功能和關系，壹般指壹個工作系統的組織或部分之間相互作用的過程和方式，如市場機制、競爭機制、就業機制等。“制度”是指國家機關、企事業單位的組織制度，如學校制度、領導制度、政治制度等。
2.這兩個詞的中心詞和使用範圍是不同的。“機制”是指生物體對壹般事物的概括，側重於事物內部各部分的機制，即關系。“制度”是指組織形式的制度，僅限於國家機關、企業和有上下級層級關系的事業單位。
3.系統廣義上是指壹個完整的大系統，可能包括壹些小系統，形成具有壹定功能的結構。就像人體有循環系統、呼吸系統等小系統組成完整的人體系統。所謂制度，就是維系國家和社會運轉的組織和制度性法律。
4.機制是指系統中各要素之間相互作用的過程和功能。機構學多用於自然科學，是指機械與功能之間的相互作用、過程、作用等等。也經常用到社會科學，可以理解為機構和制度。系統這個詞有廣義和狹義之分。
5.從廣義上講，在壹定條件下形成的政治、經濟、文化制度就是制度(或體系)，如政治制度、經濟制度、社會主義制度、資本主義制度等等。狹義上是指壹個制度或單位制定的，要求其全體成員遵守的程序或行為準則，如工作制度、財務制度、作息制度、教學制度等。這裏說的制度是指壹種公文。
擴展數據:
這兩個詞被收入《現代漢語詞典》。“機制”是指有機體的結構、功能和相互關系，壹般指壹個工作系統的組織或部分之間相互作用的過程和方式，如市場機制、競爭機制、就業機制等。
“制度”是指國家機關、企事業單位的組織制度，如學校制度、領導制度、政治制度等。
兩個詞的頭語和使用範圍不同。“機制”是指生物體對壹般事物的概括，側重於事物內部各部分的機制，即關系。“制度”是指組織形式的制度，僅限於國家機關、企業和有上下級層級關系的事業單位。
參考資料:
百度百科-機制
百度百科-體質