魚的起源很早。當世界上沒有人類的時候，魚生活在海洋裏。雖然壹些古老的物種在幾億年的進化中滅絕了，但也出現了其他新的物種。據文獻記載，魚類最早發現於4億年前的奧陶紀地層，但當時獲得的魚類化石並不完整。直到誌留紀晚期才完全獲得化石與早期脊椎動物關系的概念。泥盆紀時期，各種古今魚類都已出現。泥盆紀不僅是魚誕生的時代，也是魚鼎盛的時代。當時由於其他脊椎動物不多，有人將泥盆紀城市稱為“魚的時代”。新生代出現了眾多的魚類類群，成為脊椎動物中最大的類群，是魚類發展史上的鼎盛時期。
從泥盆紀獲得的化石分析，古代魚類可分為四類:無頜類、盾形類、軟骨魚類和硬骨魚類。無顎動物在誌留紀和泥盆紀最常見，被認為是最早的脊椎動物。化石無顎動物的身體上幾乎覆蓋著厚厚的硬骨板和堅硬的東西，因此被稱為甲魚。屏蔽魚是最早的有顎物種。它們在泥盆紀繁盛壹時，但大多數最後都滅絕了。有人認為軟骨魚和硬骨魚是由盾形魚向兩個方向進化而來，但至今仍無證據證明。軟骨魚類被認為是最“原始”的魚類，但壹般認為軟骨魚類和硬骨魚是兩個平行的分支。最早的硬骨魚是古鱈魚，然後現存的大多數硬骨魚都是由它們進化而來的。硬骨魚類中具有內鼻孔的魚類的典型原始類型是雙鰭魚類和硬骨魚類，後者是最早的泥盆紀全鰭魚類。總鰭魚被認為是最早的兩棲動物的直接祖先。
1938，1938，2月22日，有人在非洲東南沿海釣到壹條大魚，身長1.5m，體重58kg。經過專家的研究和確認，認為這條魚應該屬於頭足類的壹個新科。至此，滅絕的魚終於被追回，後來它被命名為拉蒂默(即烏魚)。這種活化石——梭魚的出現，給了我們很大的啟示。眾所周知，人類是經過漫長的過程進化而來的；魚進化成陸地上的兩棲動物，然後完全脫離水進化成陸地上的爬行動物和哺乳動物，最後進化成人類。具體來說，總鰭魚分為兩個分支，其中壹個分支(硬骨魚)出水。逐漸演變成壹個人；另壹種比較保守(空刺魚)，從不離開水面。今天的梭魚是後者的後代。狗魚的活化石為我們提供了許多化石材料無法獲得的東西。鳥類:長期以來，古生物學家通過尋找宏觀形態之間的差異來劃分不同的生物物種，重點從形態學的角度對古生物學進行分類。所以恐龍和鳥類的定義也是根據宏觀形態學所反映的特征來描述的。“恐龍”是兩種用途的統稱:具有三射帶和四射帶(骨盆)的蜥腳類和鳥腳類，所有具有此類特征的恐龍類爬行動物都被納入恐龍的範疇。同樣，作為鳥類，直觀的準則是指始祖鳥之後的有羽飛行脊椎動物及其後代。那麽，判斷基於這壹特征的生物分類是否嚴謹、科學，是否能與其進化過程中生物物種本身的特征相壹致，尤其是在對古生物化石微觀特征的認識還不是很清楚的情況下，似乎是壹種自然而然的理論和手段， 而擬定生物進化過程之間的親緣關系，根據宏觀形態學對生物本身進行分類，似乎是壹種自然而然的理論和手段，同時也足以發現宏觀鑒定的重要性。 但從生物進化論的角度來看，生物的整個進化線索並不是簡單孤立的，而是緊密聯系、不可分割的。位於壹條進化主線上的不同生物之間的關系非常密切，不同生物之間存在進化的中間過渡類型。這壹類生物起著承前啟後的作用，既保留了前壹類生物的某些特征，又具有後壹類衍生物的某些進步特征。生物體的進化史就是通過這樣的生物體寫成的。90年代末，全世界古生物學掀起軒然大波。遼寧西部發現了壹個珍貴的脊椎動物化石群——早熱河生物群。該生物群類型復雜，種類齊全，其中有鳥形和龍形化石，見仁見智。起初，這個標本是中國地質博物館季強博士研究的化石負模型(只有骨骼化石的印記和少量保存下來的化石)，被認為是比德國始祖鳥更原始的有“羽毛”的鳥，命名為“中華龍鳥”。因為化石的產出層位與始祖鳥接近，而且形狀與恐龍特別相似，還保留了當時被認為是羽毛的珍貴特征。如果是這樣的話，在教科書上統治了100多年的最古老的始祖鳥——鳥類的祖先的歷史可能會被改寫，所以這個發現是驚人的，讓世界刮目相看。不久後，另壹半作為化石出現在中科院南京古生物研究所，被專家確認為恐龍。由於古生物學的命名優先原則，沒有改名字，但叫它“中國鳥龍”似乎更貼切、更合適。兩個家族的主要爭議是，這塊化石外圍靠近骨頭的毛發狀的東西是不是“羽毛”，這是首先要了解的事實。那些認為它是鳥的人努力堅持認為它是“羽毛”，但大多數專家對此有些懷疑。他們認為羽毛的結構還沒有形成，只是壹些微絨毛，怎麽能稱之為羽毛呢？用專家的話來說就是:無論怎麽說，都改變不了形態清晰的恐龍的結構。專業的基礎能看出來他們是恐龍。消息越傳越大，中科院古人類所古脊椎動物所的專家後來對化石采集層位進行了取樣和年代測定。結果是654.38+0.246億年前，所以產生化石的義縣組的時代應該是早白堊世，不可能是鳥類，甚至鳥類的祖先，因為始祖鳥的時代在侏羅紀晚期，是654.38+0.45億年前。侏羅紀和白堊紀的傳統分界線是654.38+0.44億年，因此“中華龍鳥”是鳥類祖先的說法受到質疑。這種現象就好比猿是人類的祖先(具體來說，南方古猿是人類的直系祖先)。時至今日，我們還看不到與我們共存的類人猿嗎？對此，我們不會說是我們的祖先，否則，祖先怎麽會和進步的後代存在呢？只能說猿的大類之壹在進化過程中變成了人類。其實早在130年前，達爾文“進化論”的支持者之壹赫胥黎就提出了鳥類是由恐龍進化而來的觀點。在壹段時間內，這種學術觀點並不被接受，但在本世紀的最後幾十年裏，這種觀點幾乎得到了同事們的默許。所以通過“中華龍鳥”這個標本，說明了恐龍和鳥類的巨大相似性。而且在我國遼西發現了原始始祖鳥、偶然北漂龍、尾羽鳥等有羽毛的恐龍，進壹步說明有羽毛的脊椎動物不壹定指鳥類，恐龍也有這個特征。關於“中國龍鳥”是龍還是鳥的爭論現在應該停止了。毫無疑問，它是壹只恐龍。關鍵是提供恐龍進化成鳥類的證據。如果鳥類直接由恐龍進化而來，那麽又壹個全新的理論將誕生:恐龍並沒有滅絕。現在在藍天上飛翔的鳥是已經滅絕的恐龍的後代！兩棲類:肺魚有肺和能呼吸空氣的內鼻孔，所以長期以來被認為是最早的陸生四足脊椎動物兩棲類的祖先或近親。到了19世紀末，肺魚作為兩棲類始祖的地位壹度被全鰭魚類取代，因為全鰭魚類尤其是扇鰭魚類的骨骼系統更接近早期兩棲類。而且這些總鰭魚也有所謂的內部鼻孔，可以用來呼吸；因此，科學界逐漸認識到，頭足類亞目扇鰭魚類亞目真正的掌跖科中的硬骨魚是兩棲類的祖先。但是現在學術界還是有新的發現，各派也在爭論。
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