129 來自黑暗組織的女子 大學教授殺人事件
1.這個藥名我是絕對不會弄錯的。因為那是組織命令我調制的藥。
2.我不叫灰原哀。Sherry，那才是我的代號。沒有想到吧，高中生偵探——工藤新壹？
3.妳是我非常感興趣的研究對象，所以我想讓妳活著，如果向組織報告，妳可能在送到我這裏之前就被殺了。
4.沒辦法，我本來也不是想打算做什麽毒藥的。
5.放棄吧，工藤君，這件案子已經……將軍了。
6.為什麽，妳當時為什麽不救我姐姐呢？……妳既然這麽有推理能力，我姐姐那件事妳應該很容易就看透了啊！可是，妳為什麽沒有！
130 競技場無差別恐嚇事件（前篇）
1.名偵探壹遇到足球，就變成壹個不折不扣的少年了。
2.工藤新壹，妳大概做夢也沒想到，妳已經深深地介入了我們組織從半世紀前就開始進行的秘密計劃。
131 競技場無差別脅迫事件（後篇）
1.人是不可能逆轉時間的，如果要勉強扭曲它的話，人類會受到懲罰。
2.不愧是工藤，靠這點線索也能找出歹徒，我對妳越來越有興趣了。
3.其實我是和妳相當的18歲呢……
睿智 溫柔 予人暖意——TV中的哀 136 青色古堡探索事件（前篇）
1.太好了呢，這個，不是妳最喜歡的暗號麽？不對嗎？
2.放心吧，我對他根本沒有那種感覺。（對步美）
3.要解開這個謎題，我看只有那個在城堡裏失蹤而且好奇心旺盛的推理狂才辦得到吧。
138 最後上映的殺人事件（前篇）
1.想不到名偵探也會有搞不定的事情。
2.人類的科學所創造出來的悲劇，妳不覺得很可怕嗎？
3.這不是很好麽……偶爾讓腦細胞休息，享受壹下休閑時光。這也是我今天的計劃……用腦過度會和博士壹樣禿頭的。
139 最後上映的殺人事件（後篇）
1.妳還真平靜。我每天早上看見這個都會全身發冷。我會問，“妳到底是誰？”
2.我也覺得很抱歉。害得追逐真相的妳，必須不斷地欺騙大家，就算什麽都可以真實反映出來的鏡子，也反映不出真正的妳。（後壹句也可翻譯成“鏡子裏顯示出來的永遠只是真實的影像，而不是真實的自己”）
156 本廳刑事戀愛物語2（前篇）
不會錯，她開始發覺妳的身份了。如果妳再繼續隱瞞下去的話，根本沒意思了，只會傷害她而已。能夠看透邪惡的妳這雙正義之眼，還是不能明白女人心。她愛上妳了，自從第壹次見面之後，看來妳並沒有發覺，假面超人？（少年偵探團排練話劇時的臺詞)
176～178 與黑暗組織的再會
1.工藤，妳什麽都不知道……對方不是單憑妳就能應付的角色。稍微露出破綻就完蛋了，組織是不會放過我們的。也許就和我做的夢壹般……現在街上正有某個人……盯著我們……
2.妳還挺有正義感的嘛。不過別把我算進去，我對正義這種抽象的東西沒興趣，而且我覺得到那麽危險的地方也不能做什麽。
3.我不想再讓妳喊我是兇手了。
4.那脫下眼鏡的妳就是超人嘍？……謝謝，至少還有些安慰作用。
5.聽著，因為我可能就沒有機會跟妳說話了。
6.沒錯，將可疑的部分全部消滅，這就是他們的做法。妳應該很清楚吧，我們現在絕不能被任何人發現我們的真實身份。
188 危命的復活 洞窟中的偵探團
難道我……在逃避？開什麽玩笑。
190 危命的復活 第三種選擇
1.如果真是這樣，我就會按剛才的做。不過大多會被組織發現後滅口。
2.真是不好意思，看來我的體內還是流著冷酷的黑色的血。
192 危命的復活 新壹回來了
笨蛋，如果妳出了事，我難保不會遭到池魚之殃，所以只好先不恢復原貌幫妳，而且，妳吃的只是試用解藥，我還要仔細觀察之後，再決定自己是否要吃。
194 意味深長的八音盒（前篇）
不行——對妳這個壹遇到案件，就不管三七二十壹出面去解決的推理狂，我實在不能把解藥輕易給妳。
205 本廳刑事戀愛物語3（前篇）
我要PRADA最新款的手袋。
212 蘑菇、山熊和偵探隊（前篇）
1.蘋果是禁果。以前亞當和夏娃吃過後，就被逐出了伊甸園。所以它是“明辨是非的知識果實”。
2.重要的不是跟誰學的知識，而是要把這些知識活用，現在的妳對我來說是最好的救護人員。謝謝妳幫了我。（對光彥）
230 迷壹樣的乘客（前篇）
妳正經壹點行不行？
231 迷壹樣的乘客（後篇）
1.對，這是最好的辦法。即使僥幸逃過了這壹次，等錄口供的時候不管我願不願意都得跟那個人見面，如果我就這麽消失了，我跟組織以及其他人之間的連接點也就跟著消失了。
2.我明明早就知道…明明早就知道從自己逃出組織起，這個世界上就沒有我的容身之處了……我……真傻……我真傻對不對，姐姐？
3.這不是我的血，對，這是那個為了救我的那個傻瓜流的血。看來妳欠我的人情這次是還清了，工藤。
233 無法消失的證據（前篇）
1.被朋友排擠的危險人物，這樣詮釋其實對我來說也再恰當不過了。
2.如果我像瑪麗皇後壹樣化作斷頭臺上的露水的話，它會不會像她的愛犬迪比壹樣追隨我投身於塞納河裏呢？
3.不是瞧不起，是沒救了。（對柯南）
234 無法消失的證據（後篇）
（對小狗亞瑟）傻孩子，已經沒有人在生妳的氣了，妳放心好了。
242 元太的災難
如果妳以前不知道的話，那現在給我記住了，Gin，也是個左撇子。
246 陷入網中的謎團（前篇）
我只是覺得無路可逃，不是鯊魚，對方是壹只海豚，沒錯，海豚是海洋中最受歡迎的哺乳動物。如果是從又黑又冷的海底逃出來的鯊魚根本不能和它相提並論。
247 陷入網中的謎團（後篇）
勇氣，挺身而出的，正義的字眼……我叫灰原哀。請多多指教。（解開心結後第壹次正式向毛利蘭作自我介紹）
258 來自芝加哥的男人（前篇）
這和某人每天只會不厭其煩地尋找血淋淋的推理情節的興趣相比，要好得多了。
266 情人節的真相（事件篇）
1.每到這個日子就送心儀對象巧克力的這種戀愛遊戲，大概只有在日本才有。其實情人節這壹天的由來，是跟壹個遭人嚴刑拷問最後被處死的神父聖瓦倫丁有關。
2.所有的男孩子在收到巧克力之後，都會得意忘形的。
3.妳偵探事務所的那個女朋友呢？希望到時妳們可別像血染的情人節那樣，留下痛苦的回憶。
269 犯罪的紀念品（前篇）
1.看來妳似乎已經順利地用某種方法，從妳那個看起來有點悲哀的女朋友那裏拿到巧克力了。
2.物品會反映出創作者的心境。妳看這些巧克力。雖然臉上帶著笑容，可是表情是悲傷的，心裏明明很難過，不過還是強忍著淚水，硬擠出壹絲笑容。真的是太勉強了。（評論毛利蘭做的巧克力）
270 犯罪的紀念品（後篇）
1.只要被正義感驅使，就不考慮任何後果地追求事情的真相。為了不讓別人受到傷害，自己背負壹切。妳這種像少年壹樣的天真性格，讓人看了之後更加感興趣。但妳知道嗎？妳這種幹凈的香味，反而會使她、我還有妳自己，被這種既孤獨又危險的味道牢牢地束縛住。
2.妳的臉上寫滿了擔心兩個字。是不是和妳那個重要的女朋友有關？我就知道男孩子都壹樣，只要壹收到巧克力，就會得意忘形。（對柯南）
3.很痛苦吧，我們都是……
4.花是纖弱而短命的，即使維護起來，它們依然因喜戀陽光而枯萎，壹旦暴風雨襲來，再金貴的柵欄也保護不了它們。妳到底懂不懂啊，工藤。（評論毛利蘭的話）
279 迷宮的足球流氓（前篇）
1.那是當然的，因為背叛者是沒有容身之處的。
2.這樣不是很好嗎？可以忘記壹切，遠走高飛，逃到壹個聽不見任何噓聲的，遙遠的地方。
280 迷宮的足球流氓（後篇）
妳不是告訴過我，不要逃避自己的命運嗎？妳會保護我的對不對？不過我不像溫室裏弱不禁風的花朵，我不需要妳的保護。
290 迷途森林的光彥（後篇）
所以我才覺得困擾，因為我沒有任何感覺。我姐姐在發生那件事情之前，我也是感覺不到任何不尋常，這是我查覺危險唯壹方法。我因為習慣了這種和平生活而變得遲鈍了。看來我是越來越不行了。
304 震動的警視廳 1200萬人質
1.沒錯，歹徒就像小孩子，是壹個手上握有炸彈玩具的惡劣小子。
2.對於壹個死去的人，會以最美好的回憶永遠留在心裏，就像某人壹樣。
3.我聽到了，惡魔的呼喚。
4.妳拆除炸彈是正確的，為互不相識的人犧牲自己生命是很愚蠢的。
312 染上夕陽的布偶（前篇）
1.嗯，知道得很詳細啊，雖然妳（柯南）是男孩子。
2.我沒跟妳說過嗎？我在懂事之前就被送到美國讀書去了，親手碰到女兒節人偶這還是第壹次。爸爸媽媽好像給姐姐買過壹套，但是他們在生下我之後不久就死了，姐姐為了不勾起苦澀的回憶壹直沒有把人偶擺出來。
3.秘藥，是可以操縱人的生死的秘藥，這樣的回答妳滿意了嗎？
4.放心吧，我研究的目的不是這種夢想的藥，是這個地球上幾乎所有的人，都無法認識它的價值的可怕的東西，就像只有在這個小國家的女孩子才會重視的女兒節人偶壹樣。
313 染上夕陽的布偶（後篇）
夕陽，就是以血染世界，太陽的終結者。不知我這壹生還有幾次，能看到這種悲傷的色彩。
330 金錢買不到的友情（後篇）
就像汽水的自動販賣機壹樣，放錢進去就能解渴，不放錢的話就什麽也沒有。金錢是買不到人心的。
335 東京顯影所的秘密（前篇）
1.原來如此，從爸爸那裏遺傳到推理能力，愛出風頭滿懷自信、使用變聲機時的演技、加上生氣的時候毫不考慮後果的危險行動這些地方，果然是從母親那裏遺傳來的。
2.畢竟還是些小孩子，和我們不壹樣。
338 4臺保時捷（前篇）
是感冒而已，不用大驚小怪地來看我。
340 廁所裏隱藏的秘密（前篇）
妳還是不知道，什麽都不知道。不過，我也不希望妳知道。
341 廁所裏隱藏的秘密（後篇）
1.因為我想知道，這樣不行嗎？想知道我的父母是不是像組織裏傳說的那種人物。特別是在見到妳那麽陽光的媽媽之後。
2.不過，雖說是離開。其實根本沒有什麽地方可去。
3.等，等壹下！難道就是妳現在在聽的嗎？！不行，不要聽！！這不是妳該知道的事情！！再深入的話恐怕妳真的會被……
345 與黑衣組織直面對決 滿月之夜的雙重迷案
1.不要，工藤，這裏應該由我來面對，這和妳壹點關系也沒有。所以、所以……妳不要死，我不許妳死！
2.我不是來送死的，我來是為了結束這壹切。就算被妳抓起來了，只要我還活著，妳們的追蹤就會繼續下去，以我的生命交換，妳壹個人的約定：除我以外，妳不能對其它任何人出手。絕對不能。（對貝爾摩德）
347 尋找屁股上的印記（後篇）
1.（對步美）不行的，如果犯人沒有被逮捕的話，事情可能就會壹發不可收拾。不只是妳，周圍與妳有關的人都可能會遭到犯人的報復。
2.（對步美）妳想把犯人繩之以法的心情我可以理解，但是隱藏自己也是需要勇氣的。
3.我拒絕。通過改變名字和住址變為另壹個人的話，或許真的可以安全些。但那樣會變得不斷地重復同壹件事。擔心受怕地生活，如果自己的藏身之處被發現的話，又要再度地變為另壹個人，永遠地循環下去，而且，我還沒有完全信任妳們FBI還有……還有……就是……因、因為我不想逃避。
366 顯而易見的碼頭慘劇（前篇）
偶爾換換心情也不錯呢，在這個被稱為人類之母的大海裏，吹吹海風也不錯呢。
367 顯而易見的碼頭慘劇（後篇）
（柯南：人類的體溫對魚來說太灼熱了。）是的，對我來說太灼熱了，快要被灼傷了。
427 神秘的上學路（前篇）
如果她（指雨宮祥子）是那種會把心事藏於心底的人 壹抹會心笑，就另當別論了……好像某個人壹樣……
435 以偵探團為焦點的專訪（前篇）
高木警官和目暮警官已經有免疫力了，小林老師可是第壹次聽到妳的推理，有點不知所措啊，稍微收斂點比較好啊……妳平時做得不是挺好的嗎？啊呀呀？這樣。好奇怪啊？這樣。有點傻的小孩的樣子。妳應該明白吧，如果妳的名偵探作風被越來越多的人知道的話，遲早會傳到他們的耳朵裏。
460 1年B班大作戰
1.真是傻瓜，既然他都解得開，那我們哪有解不開的道理，何況這是小林老師專為我們小學生設計的暗號，並不是留在命案現場令人費解的死前留言或是藏寶圖，應該光靠我們的力量就能解開才對呀，根本沒理由壹開始就打退堂鼓吧。
2.這沒有什麽不好意思的，方言是語言的屬性，暫時不用可以，但是絕不應該扔掉，那裏面可記錄著妳成長的重要的信息。
3.我總算了解壹點工藤的辛苦了。
488 電視臺的惡魔
1.惡魔的世界也很殘酷呀。
2.簡直如同童話壹般，當惡魔留下眼淚的同時，也就失去了魔力。
495 紅與黑的碰撞 昏睡
就像FBI被稱為“事務所”壹樣，“Company”也是俗稱，是為了貫徹執行美利堅合眾國的國策，收集情報，進行對外工作，直屬於總統的間諜情報機關，就是CIA。
501 紅與黑的碰撞 嫌疑
1.這個妳應該知道吧，最好不要太小看組織了，特別是Gin。
2.真的明白嗎？還有那個瑛佑他說他接受證人保護計劃嗎......是啊，我當時也不接受的。
3.說起來那個秀壹我很感興趣呢，無論怎麽樣，他可是願意聽妳這個壹年級小學生意見的FBI的厲害人物呀，我很感興趣呀......什麽，有什麽原因不能讓我見見嗎......難道說、難道說……那個人不會是Loli控吧？
509 紅白黃色與偵探團
1.這表示很和平呀，不是很好嗎？
2.這個感覺！盯得獵物無法動彈的視線，將獵物剖腹斷腸般的壓迫感……在！就在這附近！有組織的同夥！
3.在這裏，絕對就在這裏，剛才給我沈重壓迫感的，組織的同夥。如果不快點知道他是誰的話，如果不做點什麽的話，這些孩子也會受到牽連的……
523 真正想問的事
傻瓜（對毛利蘭），妳仔細看看吧。工藤穿著的外套的左邊，從袖口下面壹直到側邊，不都是裁開然後用別針別上的嗎？那是他左手被妳拽著穿衣服的證據。所以妳沒什麽不甘心的。
536 消失的名畫的秘密
真完美，完美的讓我頭暈……
587 基德VS四神偵探團
是啊……不該看到的東西妳也看到了……色狼……
598 蒸汽密室的劇本（後篇）
嘛～小孩子的裸體什麽的……就算被看到……也無所謂的吧～（對柯南）
622 緊急事態252（前篇）
1.（冷調吐字……對柯南）妳不會，真的，向她告白了吧？~（後可以看出柯南無奈的半月眼加臉紅）
2.不過這也沒辦法……對於壹個拼命想要躲藏的人，還能堅持不懈地追到底，非要把他找出來才罷休，擁有這樣的能力的人才是真的鬼呢！
656 博士的視頻網站（前篇）
這不是妳的錯，我才是罪魁禍首，這壹切都是因為我的這種糟糕的境遇導致的！
劇場版
M 4《瞳孔中的暗殺者》
如果是我，可以的話，倒寧可失去記憶，這樣就可以忘記壹切，姐姐被殺和以及我成為組織壹員制作毒藥的事，如果都能忘了，做壹個單純的小學生灰原哀，不知該有多好……然後，就能跟妳永遠……永遠這樣……開玩笑的，精神好點了沒有？
M 5《通向天國的倒計時》
1.也許這說明十年後我們都不在這個世界上了呢？
2.我的心情誰都不會了解！
3.昨天真的很抱歉，我也知道這樣做是很危險的，也知道得把這個習慣改掉才行，可是只要我壹個人覺得寂寞、害怕得不得了的時候，就會不知不覺地拿起話筒，只想聽聽不到十秒的……姐姐的聲音。
4.我想也差不多該是時候了。我不會再做了，我已經把留言消掉了，所以妳不用擔心。不過，最近我常常在想，我到底是誰？我的容身之處又在哪裏？哪裏都沒有可以容納我的位子。
5.笨蛋，壹定要這樣數才會準啊！（下了莫大的決心做的決定，決定犧牲自己救其他人）
6.如果妳讓吉田傷心的話，我可不會原諒妳喔。
7.原來我跟米粒是壹樣不能被落下的啊！
M 6《貝克街的亡靈》
1.簡直就像是醜惡的日本世襲制度的濃縮版景象，伴隨著這種世襲制度，人類的錯誤歷史也將不斷的重演。
2.政治家的兒子將成為政治家，銀行總裁的兒子將成為銀行總裁，這樣下去，不管過多久日本還是不會改變。
3.怎麽樣？這樣行了吧。
4.（經典名言）妳絕對不能放棄喔，工藤。如果找不到幫助我們的角色，對我們而言，妳就是福爾摩斯。妳擁有這種能力，沒有什麽案子是福爾摩斯解決不了的。
（日語原文：だめよ，工藤君，あきらめじゃ。お助けて人がないなら，私たちにとってのホ-ムスはあなた，あなたにはそれだけに力がある。ホ-ムスに解けない事件はないでしょう）
M 8《銀翼的魔術師》
1.看來妳的字典裏也沒有“不可能”這三個字，工藤。
2.還有壹種可能，或許妳才是冒牌貨。
M 9《水平線上的陰謀》
1.不可能的，人是有感情的動物，而感情是看不見的，所以才會十分善變。如果那只是友情或愛情也就罷了，但壹旦因為某種契機，壹旦轉變成妒忌亦或是憎恨，殺意也隨之萌生。
2.案件……真的僅此而已嗎，工藤？
M 10《偵探們的鎮魂歌》
1.還有5秒。再不快點打方向盤，5秒後會猛撞上墻壁哦。
2.那我們的性命就交給妳了，名偵探。
3.這種表演，累死我了。
4.不想死就別動！（對元太）
M 11《紺碧之棺》
1.我什麽時候成了妳的助手了？
2.妳還真會說話。
M 12《戰栗的樂譜》
1.而且，我也相信著他，作為搭檔。
2.我本來就不是小孩子。
3.托他（柯南）的福，我沒少擔驚受怕；但是在音樂課上，就是另壹種意義的擔驚受怕了。
M 13《漆黑的追跡者》
1.能爬到那麽上面的，估計只有江戶川同學和猴子先生了。 迷人的可愛眼神
2.即使我讓妳放手，妳也不會聽的吧。
3.妳還不明白嗎？妳越是解開事件就越證明妳是工藤新壹啊！
M 14《天空的遇難船》
我也想乘坐這翺翔空中的魔法之船，飛去雲上的夢幻國度。
M 15《沈默的15分鐘》
1.不過有人正對其他事情入迷著呢。
2.只要稍不註意他（博士）就掉進肥胖癥候群了。
3.那麽，我也出壹個謎語，在那些吃的裏最適合博士吃的是哪個？答案是哪個都不行，都是肥胖的根源。
4.妳（柯南）還真是壹如既往的堅強啊。
5.絕對不會讓妳（柯南）壹個人去的。
6.妳作為壹個小孩子也太亂來了吧。