首先，我想重復壹下，德語語法中的壹個原則。即，名詞有陽性，中性，陰性3類。有單數與復數2種形式。還有壹、二、三、四等四個格。而名詞前面的冠詞，指示代詞，物主代詞，形容詞等，必須與名詞保持性、數、格的壹致。就是說，名詞是“根", 形容詞等定語，只是“保持壹致”而已。
回到妳這個問題，應該強調，只有名詞在壹個句子中的語法地位是第二格時，它前面的形容詞才是第二格形式。而名詞是否為第二格，與它有否形容詞定語沒有任何關系。
現在說說名詞的第二格如何變化。應該說，第二格的變化沒有嚴格的規則。要對每個單詞學習掌握。這也就是為什麽字典上，把每個名詞的第二格詞尾都標註的原因之壹。
不過我們在學習時，還是有個大體的規則的，使用這個規則可以使我們的記憶“事半功倍”。
這個規則有3點：
1. 多數的陽性與中性名詞，第二格時，詞尾加-(e)s。
這裏的(e)表示，單音節名詞要加-es, 多音節名詞就不加e了，只加-s。例如，
der Vater, des Vaters
das Jahr, des Jahres
2. 所有的陰性名詞，第二格時，形式皆同第壹格。即，第二格無變化。例如，
die Woche, der Woche
die Zeit, der Zeit
3, 少量的描述人與動物的陽性名詞，第二格時，詞尾加-(e)n。這些名詞也稱為弱變化名詞。
這裏的(e)表示，名詞的結尾為-e, 則只加-n。否則加-en。例如，
der Student, des Studenten 大學生
der Junge, des Jungen 男孩
der Hase, des Hasen 兔子
從上面的3條規則看，只要我們把屬於第3條的陽性名詞記住了，其它名詞就都好解決了。
註意，這只是“大體規則”。例外的情況還是不少的。 不過我們只要把“不規則”的例外記住，也就可以了。
因此，妳說的“所有第二格的有形容詞修飾的陽性和中性名詞詞尾都要加—es或者—s，而沒有形容詞修飾的陽性名詞第二格形式只有壹小部分加—s” ，是壹個不靠譜的規則。妳還是從上面的3條大體規則入手，去掌握名詞的第二格形式。
妳引用的句子中，Vater從含義上看，的確是壹個描述人的陽性名詞。但“大體規則”中並沒有說全部的描述人和動物的陽性名詞。就是說，屬於第3條規則的只是壹部分名詞，就是稱為“弱變化”名詞的那些詞。這個需要單獨記憶。Vater還是屬於第1條範圍內的名詞。
在我們沒有把握的時候，就要查字典了。