那是在1686年，正值康熙皇帝當政，把國家治理得井井有條，康熙強調興禮教，他曾下詔說：盛治之世，余壹余三。蓋倉廩足而禮教興，水旱乃可無虞。比聞小民不知積蓄，壹逢歉歲，率致流移。夫興儉化民，食時用禮，惟良有司是賴。
康熙自幼就對儒家學說充滿濃厚興趣，認為“殊覺義理無窮，樂此不倦”，他在禦制《日講四書解義序》中，明確宣布清廷要將治統與道統合壹，以儒家學說為治國之本。
同時，康熙皇帝還曾多次舉辦博學鴻儒科，創建了南書房制度，並親臨曲阜拜謁孔廟。康熙還組織編輯與出版了《康熙字典》、《古今圖書集成》、《歷象考成》、《數理精蘊》、《康熙永年歷法》、《康熙皇輿全覽圖》等圖書、歷法和地圖。
上行下效，在這種情況之下，全國的文化氛圍都很濃重，湖南巡撫丁思孔率所屬及士紳對嶽麓書院進行了大規模重建，恢復了舊有格局。
隨後，朝廷準了丁思孔所請，1687年春，禦書“學達性天”匾額，並十三經、二十壹史、經書講義遣送到嶽麓書院，因此建了禦書樓。到清代中期，嶽麓書院禦書樓發展成為我國民間壹座較大型的圖書館，藏書14130卷。
之後，長沙郡丞趙寧在書院東面200米處的路旁建了壹座自卑亭，以供行人歇足之用。後來到嘉慶年間，時任山長袁名曜改建於路中，擴建道路於亭側，形成後世看到的格局。“自卑亭”三字為清代山長車萬育題書，亭內嵌有《自卑亭記》等碑刻。
到了1733年，雍正帝發布上諭，扶持壹些省會重點書院，稱之為“省城書院”。嶽麓書院和原長沙府城南書院被列為省城書院，每個書院給予帑金1000兩，以示支持。其後，湖南巡撫等地方官多次撥款以作書院經費。
1743年，蔣溥任湖南巡撫，上疏請求乾隆賜額。乾隆禦書“道南正脈”，以表彰書院傳播理學之功。至此以後，嶽麓書院得稱理學“道南正脈”，四方求學者絡繹不絕。
乾隆以後，由於乾嘉學派的影響，壹些從事詁經考史的經學家主持書院，他們在嶽麓書院研究和傳播經學。其中，王文清就被乾隆皇帝授為內閣中書科中書舍人，奉直大夫，考錄禦史，世人尊稱其為“九溪先生”。王九溪與衡陽王夫之、湘潭王闿運、長沙王先謙並稱為清代湖南“王氏四大家”。
後來王九溪以父老乞請終養，在禦史任上退休回鄉，回湘後他潛心著述，以傳播學術、振興湘學為己任。1748年，王九溪被聘為嶽麓書院山長，主講書院達14年之久。王九溪很註意培養學生“通曉時務物理”和詁經考史的務實學風。
1782年，羅典被聘為嶽麓書院院長。羅典，字徽五，號慎齋，湖南湘潭人。1747年鄉試第壹，乾隆十六年（1751年）殿試傳臚。他學識淵博，才高氣正，治學嚴謹，育才有方，深得學生喜愛。
羅典非常重視書院的環境美化，精心策劃建設了“嶽麓八景”。他認為讓生徒到大自然中去接受美的陶冶，不失為造士育才之良法。在壹次講課過程中，他侃侃而談植物的栽培之道。他說，種竹栽荷，“取其行根多而繼增不息也；插柳或木芙蓉，“取其自生也”；種植桃李，“取其易實也”；移植紫藏、山躑躅，“取其發榮齊而照爛靡也”。這種隨意點評，寓教於山水花木之趣的教育方法，使生徒各依情趣和才智自由發展，不拘壹格，充分發揮各自的創造精神。羅典是位經學家，但是興趣卻十分廣泛。他每年都要拿出自己的俸金，增修書院，嶽麓山的柳塘煙曉、桃塢烘霞、桐蔭別徑、風荷晚香、曲澗鳴泉、碧沼觀魚、花墩坐月、竹林冬翠8景，都是他親手指點加工修飾的。為了方便遊客欣賞秋山紅葉，他還在書院後面的清楓峽口上建了壹座亭子，取名紅葉亭。
到了1807年，山長羅典在嶽麓書院舉行重赴鹿鳴宴宴會。鹿鳴宴，指的是古代的地方官宴請科舉考試中的考官和中試的學生的宴會，因為宴會上通常都演奏《詩經·鹿鳴》從而得名。
重赴鹿鳴宴是指鹿鳴宴60年後而舉行的宴會。在嶽麓書院歷史上，羅典是僅有的兩個重赴鹿鳴宴的山長之壹。在嶽麓書院舉辦鹿鳴宴這壹天，達官貴人、科場舉子雲集嶽麓書院，大家談古論今，吟詩作賦，熱鬧非凡。