先說妳幾句，妳這程序寫得還真是把看官折騰得夠嗆，我反正是費了些工夫才弄明白妳在幹什麽。
而且妳這並不是排序，只是按字典序輸出而已，序其實沒變，對吧。。
先是壹個語法錯誤：
else if (replacement[m][n]=temp[n]) //“==”
count1++;
然後是邏輯問題：
for (int n=0;n<compare(ch[m],ch[J]);n++)
if (replacement[m][n]<temp[n])
{ for (int l=0;l<strlen(ch[m]);l++)
temp[l]=replacement[m][l];
J=m;
break;
}
else if (replacement[m][n]=temp[n])
count1++;
這段判斷並沒有實現字典序的比較，比如adjk，Bdkj作為輸入時，判斷並沒有在a，B的差異上打住，而是繼續判斷到j,k。
只要再加壹句
else
break;
就行了，至少妳的這個反例是沒什麽問題的。
看得出妳是初學者，至少是初學者等級，能寫到這程度值得稱道。
不過給妳提幾個小建議：
1.
for (int k=0;k<count;k++)
if (exist[k]==true)
break;
int J=k;
不要這樣使用k，現在的標準是for(int i;;)中的i是局部變量，出了循環就無效了。雖然vc6可以通過編譯。
2.
for (int n=0;n<compare(ch[m],ch[J]);n++)
這裏的compare函數用的不好，它會隨著每次循環都運行壹遍，若是這個值壹直不變還好，萬壹變了，這玩意就是無底洞，想陷多深就多深。。
3.與其映射成雙精度數字，全都轉化為小寫或者大寫再比較不也挺好嗎？省時省力省空間。
就這些吧，請好好加油~
最後推薦使用C++風格的程序，雖然我寫得不壹定好，但好歹是真的C++程序……
以下C++程序實現了妳的需求：
#include <iostream>
#include <algorithm>
#include <string>
#include <vector>
#include <cctype>
using namespace std;
bool comparator(string a, string b){
char c1,c2;
for(int i = 0 ; i < a.length() ; ++i)
{
if((c1 = tolower(a[i])) != (c2 = tolower(b[i]))){
return c1 < c2;
}
}
return true;
}
int main() {
vector<string> vec;
string temp;
cin >> temp;
while(temp != "#") {
vec.push_back(temp);
cin >> temp;
}
sort(vec.begin(),vec.end(),comparator);
for (vector<string>::const_iterator iter = vec.begin() ; iter < vec.end() ; ++iter)
{
cout << *iter << endl;
}
return 0;
}