當初挑選裝箱運至臺灣的文物, 著重具有在中華文化延續性的文物, 也就是著重在各朝歷代的重要文物。但由於時間以及載運船只不足, 因此大件器物大多舍棄不帶。也因此大件器物成為北京故宮的特色比如大禹治水玉山以及磁王等。
然,臺北故宮帶走的器物,以當時的博物學來說, 皆多為上上等。比如:
在書畫方面, 當時記載於宣和畫譜, 石渠寶笈, 秘殿珠林 中幾乎當時所能拿到的全部的宋元以及重要繪畫皆裝運至臺灣,至於有些留在宮中的,則大多為來不及清點或是在當時有爭議的書畫, 比如徽宗的聽琴圖。因此這裏有漢晉以來，唐宋元明清歷代大家的書畫真跡。如王羲之、懷素、顏真卿、蘇東坡、黃庭堅、嶽飛、趙構、米芾、馬遠、文征明、唐寅、祝允枝、郎世寧、鄭板橋等人的傳世之作。
比如書法,宋代是代表了中國書法的巔峰,蘇軾, 黃庭堅, 米芾,蔡襄 這四人更是宋代書法公認最好的,可惜的是我國內博物館中能藏有壹幅蘇軾, 黃庭堅, 米芾,蔡襄真跡的真的屈指可數,但臺北僅米芾相關的真跡竟達78福,且件件是代表作,比如上海博物館的鎮館之寶宋 米芾《蘇太簡參政帖》,但比起臺北蜀素帖又差上壹截了,更遑論臺北故宮珍藏的赤壁賦,寒食帖 這千年前蘇軾的真跡了。這裏陳列的唐代法書也堪稱絕品,懷素的自敘帖,顏真卿祭侄文稿，後人將其書品列為“唐人第壹，神品之首”。書聖王羲之的書法精品《快雪時晴帖》、《七月都下帖》王羲之《長風帖》王羲之《遠宦帖》王羲之《大道帖》王羲之《何如》、《奉橘》帖，個個鐵劃銀鉤，形神兼備，剛柔相 濟，更是令人大開眼界，大飽眼福。
繪畫當時幾乎是全部裝箱南遷,南遷中除了不重要的清代帝王的手跡,歷經宋元明清歷代珍藏的的書畫史上的代表作更是幾乎都帶去臺灣了除了及少數留在宮中的,則大多為來不及清點或是在當時有爭議的書畫, 比如徽宗的聽琴圖。因此收藏於臺北故宮的畫卷中有唐至清歷代名家代表作，這裏收藏了中國書畫史上80%以上的代表作品。如唐代閻立本《職貢圖》等，無不價值連城。其他名家的畫作還有李公麟的《免胄圖》、陳居中的《文姬歸漢 圖》、仇英的《漢宮春曉》、範寬的《溪山行旅》、郭熙的《早春圖》唐代閻立本《蕭翼賺蘭亭圖》 李思訓《江帆樓閣圖》李昭道《明皇幸蜀圖》韓幹《牧馬圖》唐人《宮樂圖》後梁荊浩《匡廬圖》關仝《秋山晚翠圖》趙巖《八達春遊圖》南唐董源《洞天山堂圖》、《龍宿郊民圖》巨然《層巖叢樹圖》、《秋山問道圖》趙幹《江行初雪圖》五代人《秋林群鹿圖》、《丹楓幼鹿圖》北宋範寬《臨流獨坐圖》 黃居寀《山鷓棘雀圖》宋徽宗《蠟梅山禽圖》、《文會圖》、《池塘秋晚圖》李唐《萬壑松風圖》、《江山小景圖》錢選《桃枝松鼠圖》易元吉《猴貓圖》、《枇杷猿戲圖》崔白《雙喜圖》文同《墨竹圖》蘇漢臣《秋庭戲嬰圖》宋人《小寒林圖》、《梅竹聚禽圖》、《江帆山市圖》金代武元直《赤壁圖》南宋牟益《擣衣圖》宋高宗《女孝經馬和之補圖上卷》張勝溫《梵像圖|宋時大理國描工張勝溫畫梵像》趙伯駒《漢宮圖》蕭照《山腰樓觀》劉松年《羅漢》馬遠《雪灘雙鷺》軸、《華燈侍宴圖》馬麟《靜聽松風圖》夏圭《溪山清遠圖》陳居中《文姬歸漢圖》宋人《岷山晴雪圖》、《千手千眼觀世音菩薩圖》、《折檻圖》、《秋塘雙雁圖》軸、《寒林樓觀圖》、《翠竹翎毛圖》、《如來說法圖》元代趙雍《駿馬圖》高克恭《雲橫秀嶺圖》王淵《松亭會友圖》王蒙《谷口春耕圖》方從義《神嶽瓊林圖》劉貫道《元世祖出獵圖》吳鎮《雙松圖》趙孟頫《鵲華秋色圖》黃公望《富春山居圖》等。壹幅幅字畫筆意嚴謹工細，氣象清勁瀟灑，都是歷代書畫中的極品。
在青銅器方面, 當時選擇自兩晉、隋唐、宋、元、明、清代, 歷代王朝交替而傳下來的傳世國器以及重要史料價值的河南出土文物裝運至臺灣,如世界銘文最多的青銅器毛公鼎, 世界最早的土地議合契約散氏盤,現存最多銘文的青銅編鐘宗周鐘, 春秋歷史的重要史料子犯龢鐘等,珍藏於臺北故宮的青銅器機囊闊了古中國青銅時代的各類型作品, 此外如北魏太和元年的《青銅鍍金釋迦牟尼佛坐像》等歷代的重器與金銅佛像件件都極具史料價值與歷史意義,件件是驚絕的國之瑰寶。
在瓷器方面選擇在該種類中最為精美的,比如紅寶石僧帽壺就是當時最好的紅寶石宣德款瓷器, 再比如當時所能找到依據”埏埴流光”冊中記載的23件汝瓷全都帶來了臺灣。所謂“天下名瓷，汝窯為魁”, 如果汝窯是瓷器中的第壹的話那這件收藏於臺北故宮的北宋汝窯青瓷無紋水仙盆就是汝瓷中第壹了, 因為她是現存汝磁中唯壹完美無暇 幾乎看不到顯著開片的北宋汝瓷。 此外臺北故宮當時著將年代較久遠的宋代五大名窯,因此五大名窯幾乎悉數都運到了臺灣。而之後的元代以及明代清代希珍瓷器,比如元朝青花, 成化鬥彩, 萬歷五彩的最精美作品,所以明代官窯特別是最頂峰的永宣青花2248件絕品在臺北故宮,也就是世界上永宣青花超過70%在臺北故宮且件件是精品和絕品,在明瓷,臺北故宮還聚珍了清宮遺藏的大量成化瓷精品。我們知道國內能藏有壹件以上成化瓷器的博物館已是鳳毛麟角,但是據資料可考，臺北故宮所藏成化器就達 599 件，其中鬥彩 247 件，僅以成化鬥彩雞缸杯為例，全中國也僅12件,僅臺北故宮就藏有 11 件，數量之多令世人無語。除此之外，弘治604件、正德700餘件、嘉靖966件、萬歷522件等時期的官窯制品也蔚為大觀，堪稱系列,件件皆是無法以金錢計算的國寶。至於清代特別是康雍乾三代最重要的瓷器-琺瑯彩瓷,現存不超過460支, 其中460件被帶到了臺北故宮。這些堪稱清代瓷器中無上的菁華絕品，所以最終也被國民政府輾轉帶到臺灣,然不僅琺瑯彩瓷，臺北所藏其它官窯質量也非常高,件件都堪稱該類典型代表，不論繪畫質量還是制作數量都不可多得,由於60年前國民政府代子的這批皇家藏瓷,另臺北故宮瓷器收藏足以傲視世界其他博物館,堪稱世界第壹。
再器物方面(當時僅簡單分為這幾類) 著重在點集中有記載的器件, 比如乾隆欽定《西清硯譜》所收載之中華古硯正譜為二百方、另有附錄者為四十方，總計為二百四十方。超過世界現存半數藏於臺灣故宮博物院95方。或是皇宮禦用珍玩(比如多寶格巧器全數藏於臺北故宮), 或是具有特別難得雕刻技法(比如痕都斯坦玉器), 這是種壹器壹色 薄胎如蟬翅的玉器, 乾隆詩雲：「西昆率產玉，良匠出痕都。」痕都斯坦玉精品，原均集中於北京紫禁城內乾清宮暖閣內與圓明園殿座之中。乾清宮於乾隆歸政前，被壹場大火燒得精光。圓明園則在八國聯軍時被毀, 因此所有現存古籍善本所提及的痕都斯坦玉精品當時幾乎全都到了臺北故宮。
再者臺北“故宮”珍藏善本圖書，***149514件，約50萬卷。首數文淵閣《四庫全書》，自然為研究中國古代文史最重要的典籍，是七部《四庫全 書》中最珍貴的壹部。此外，尚有《四庫薈要》和《宛委別藏》，系《四庫全書》編妥後，把繼續收齊到的書籍173種編成此書，這是嘉慶皇帝最真愛的書籍,更具有無上的史學價值。在善本圖書中，可以見到宋元舊塹、舊鈔，如宋本《尚書》、《周禮》，宋版歐體的《大字蓮華經》，宋道藏本《雲寶簽》，元刊本《元豐類稿》、 《宣和畫譜》、《元典章》，以及宋朝最古老的淳化、鹹平年間，由杭州龍興壽所刊的《華嚴經》等。明代永樂年間中國與鄰國交往的字典《華夷譯語》，實為研究 中國古代外交史的珍貴工具。在蒙藏文書類中的《藏文甘珠》及《甘珠》等，全部用泥金寫成。至於文獻壹類，***38萬件，其中包括中國近代史每壹個朝代的公 文檔案，如來批與敕論，內外臣的題本與奏本，各國及外藩的國書表章，歷朝的“玉雕”、“聖訓”、“實錄”等，都是中國近代史極其珍貴的第壹手史料。其中特 別珍貴的有：明太祖朱書禦筆多件，清太祖本紀、清穆宗親政詔、韓國致清國國書、清國致英國法國國書、民國大總統袁世凱致清帝宣統國書等等。
此外63箱重要外交文檔也收藏在臺北故宮,因此臺北故宮收藏了近代幾乎所有重要條約文本,如《中俄續增條約》《伊犁條約》《馬關條約》《南京條約》辛醜條約 中德通商條約 中俄北京條約 中法北京條約 中英北京條約 中法天津條約 中英天津條約 中美天津條約 中俄天津條約 中俄璦琿條約《尼布楚條約》等外交文本
所以早期有人說北京故宮有宮無寶, 臺北故宮有寶無宮, 但是北京故宮經過這數十年來從全國各地徵集以及許多海內外人士的無私捐獻, 加上許多考古挖掘, 館藏文物回到了180幾萬件, 如果扣除瓷器標本破片, 以及不完整的器物, 或不具歷史價值的文物, 精品部份大約有30萬件,雖補足了原先缺乏的,但比起臺北故宮的歷代精品,確實又差上壹結了。