1．管理信息系統
管理信息系統壹般包括：
門、急診掛號子系統
門、急診病人管理及計價收費子系統
住院病人管理子系統
藥庫、藥房管理子系統
病案管理子系統
醫療統計子系統
人事、工資管理子系統
財務管理與醫院經濟核算子系統
醫院後勤物資供應子系統
固定資產、醫療設備管理子系統
院長辦公綜合查詢與輔助決策支持系統
2．臨床醫療信息系統
臨床醫療信息系統可能包括的內容很多，甚至可能是專科、專病、專課題的信息處理系統，下面給出壹些常見系統的例子：
住院病人醫囑處理子系統
護理信息系統
門診醫生工作站系統
臨床實驗室檢查報告子系統
醫學影像診斷報告處理系統
放射科信息管理系統
手術室管理子系統
功能檢查科室信息管理子系統
病理卡片管理及病理科信息系統
血庫管理子系統
營養與膳食計劃管理子系統
臨床用藥咨詢與控制子系統
3．醫院信息系統的高級應用
醫學圖象實時傳輸與查詢、歸檔系統
（PictureArchivingandCommunicationSystem,PACS）
病人床邊信息系統
計算機化的病人病案系統（CPR）
科研支持系統
教學支持系統
Internet醫學情報系統
遠程診斷與教學
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