首先是規模的擴大。《故訓匯纂》引用典籍的時代比《經籍籑詁》多出千余年，範圍不但收全了10部“小學”專書的義訓條目，而且在經史子集故訓之外，擴充到近代筆記和佛經註釋。其篇幅約為1300萬字，超出《經籍籑詁》四倍，克服了《經籍籑詁》搜輯不備的缺點。
其次是編排體例的重新設計。全書改用《康熙字典》的214部排列，實現了黃季剛先生重編《經籍籑詁》的理想。更重要的是，《故訓匯纂》的編例，是在現代語言文字學觀念的指導下創立的。在詞匯學方面，它收錄了大量的復音詞，包括先秦典籍的復音詞，打破了上古漢語極少復音詞的成說。在文字學方面，它嚴格把握異體字，關註了簡繁字對應中的諸多復雜問題，清理了字用學中通假、分化等相關概念。在訓詁語義方面，辨析了形訓、音訓、義訓，分清了假借與同源，註意了本義、引申義和假借義。在音韻學方面，它重視《廣韻》反切與現代音的配合標註，處理又音問題時，不但從語音發展的角度，分析了又音發展的趨勢，而且註意了以音別義的語言事實。壹部要處理如此眾多的材料，又並非理論之作的纂集專書，在前人各種書籍的編纂各行其是的情況下，采用了如此自覺、科學的編例，難度之大，可想而知。