1、性質不同
身份認證指通過壹定的手段，完成對用戶身份的確認。
消息認證（message authentication）指驗證消息的完整性，當接收方收到發送方的報文時，接收方能夠驗證收到的報文是真實的和未被篡改的。它包含兩層含義：驗證信息的發送者是真正的而不是冒充的，即數據起源認證；驗證信息在傳送過程中未被篡改、重放或延遲等。
2、目的不同
身份驗證的目的為確認當前所聲稱為某種身份的用戶，確實是所聲稱的用戶。在日常生活中，身份驗證並不罕見；比如，通過檢查對方的證件，我們壹般可以確信對方的身份。雖然日常生活中的這種確認對方身份的做法也屬於廣義的“身份驗證”，但“身份驗證”壹詞更多地被用在計算機、通信等領域。
消息認證目的為了防止傳輸和存儲的消息被有意無意的篡改。
3、方法不同
身份驗證的方法有很多，基本上可分為：基於***享密鑰的身份驗證、基於生物學特征的身份驗證和基於公開密鑰加密算法的身份驗證。不同的身份驗證方法，安全性也各有高低。
消息認證包括消息內容認證（即消息完整性認證）、消息的源和宿認證（即身份認證0)、及消息的序號和操作時間認證等。它在票據防偽中具有重要應用（如稅務的金稅系統和銀行的支付密碼器）。
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