壹、指代不同
1、全文搜索引擎：通過從互聯網上提取的各個網站的信息（以網頁文字為主）而建立的數據庫中，檢索與用戶查詢條件匹配的相關記錄，然後按壹定的排列順序將結果返回給用戶。
2、目標索引類搜索引擎：是以網頁形式提供查找網絡資源的壹種網絡信息檢索工具。
二、特點不同
1、全文搜索引擎：以各類數據如文本、聲音、圖像等為對象，提供按數據的內容而不是外在特征來進行的信息檢索，其特點是能對海量的數據進行有效管理和快速檢索。
2、目標索引類搜索引擎：使用自動索引軟件來搜集和標記網頁資源，並將這些資源存入數據庫。當用戶輸入檢索的關鍵詞後，它在數據庫中找出與該詞匹配的記錄，並按相關程序排序後顯示輸出。
三、影響不同
1、全文搜索引擎：是搜索引擎的核心技術，同時也是電子商務網站的支撐技術。全文檢索技術可應用於企業信息網站、媒體網站、政府站點、商業網站、數字圖書館和搜索引擎中。
2、目標索引類搜索引擎：由自動索引軟件生成數據庫，所收錄的網絡資源範圍廣、速度快、更新及時，但因缺乏人工幹預，準確性較差。這類檢索工具適用於查找特定的信息以及專指性強或不易明確分類的具體問題，例如百度搜索引擎。
百度百科-索引型搜索引擎
百度百科-全文搜索引擎