尚書右仆射房玄齡、侍中王珪掌管朝廷內外官吏的考核，萬紀彈劾他們不公正，太宗核查 實情，王珪不服。魏征上奏說： “房玄齡等人都是大臣，考核官員有偏心，萬紀在考堂沒 有校正錯誤，現在卻檢舉揭發，這不是誠心為國著想啊。 ”太宗皇帝於是就擱置了此事， 但是認為萬紀不逢迎權貴近臣，從此就獎勵他，禮遇他。萬紀又建議說： “宇文智及受隋朝恩遇，卻殺死他的君王，他的後世永不錄用，現在他的兒子竟然擔任千牛衛，請您斥退 他的兒子以便懲罰他的不法行為。 ”皇帝聽從了他的建議。萬紀與侍禦史李仁發憑借建言 獲得晉升之後，彈劾越發放縱，眾人心感恐懼。魏征上奏說： “萬紀等人不明大體。詆毀、 揭短、彈劾都不符合實情。陛下接受他們的壹切言論，他們才敢偏袒下屬欺騙君上，撈取 剛正的名聲，惑亂君王聖明的心。讓小人謀害大臣，群臣會離心離德。像房玄齡這樣的大 臣尚且不能申訴，更何況被疏遠、地位卑微的臣子呢？”太宗皇帝（聽後）醒悟過來，貶 萬紀為散騎常侍（太宗時，為閑職） ，而且免了仁發的官職。幾年之後，朝廷又召回萬紀 擔任持書禦史，他隨即上奏說： “宣、饒地區可以開山煉銀，每年可以獲取數百萬。 ”太宗 皇帝責備他說： “天子缺少的，是有益於國家的良好計謀和政策。您不推舉賢才進獻良策， 卻用利益規勸我（勸我牟利） ，想把我比作漢代的桓帝、靈帝嗎？”斥令他回府反省。
過了很久， 萬紀從禦史中丞晉升為尚書左丞， 出京擔任西韓州刺史， 後調為吳王長史。 吳王害怕他的剛直，就友好地對待他。齊王李佑不守法紀，太宗皇帝向來賞識萬紀能控制 吳王的能力，就調他擔任李佑的長史。李佑親近小人，萬紀屢次進諫去不被采納，就逐條 列出他的過失上報皇帝。
拿走不謝，試卷選文第二段是不完整的，《新唐書》第二段內容比這要長。
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