建興元年(公元313年)，為避諱晉帝司馬曄，建業改為建康。
1933年，南京開始設置區級建制，為第五區。
1950 6月變更為第四區。
建鄴區於1955年8月命名。
1967年3月更名為宏偉區。
1973 65438+2月恢復到建鄴區。
4月1995，11，雨花臺區江東鎮下轄的河南、索街、興隆、向陽、林東5個行政村，人洞橋、棉地、螺螄橋3個居委會，以及原茶亭行政村劃歸建鄴區管轄，新設街道辦事處；4月24日，市政府在區劃調整辦公室舉行了交接簽字儀式。4月27日，在南湖新村西南，東至南河，南至雨花臺區青石村、紅旗村，西至棉地夾江，北至鼓樓區江東村，設立興隆街道辦事處。新成立的興隆街道辦事處轄安國、安泰、安民、安康、螺螄橋、任棟橋、棉地7個居委會，河南、索街、興隆、向陽、林東5個村委會，安如、安義2個居民區，面積8.24平方公裏。人口9927戶34268人；5月18正式上市。河西地區其他部分:茶亭東街中心線以南、白鹿村以東、慶忌路西延中心線以北，歸南湖街道管理；魏碑路以西，茶亭東街中心線以北，原茶亭村與江東村河道分界線中心線以東，鳳凰西街以南，為莫愁湖街道管理的區域。6月65438+10月65438+6月，“愛達花園公寓”由雨花臺區移交至建鄴區興隆街道辦事處。
2000年，建鄴區轄6個街道。根據第五次人口普查數據，全區總人口358966人，其中莫愁湖街道71167人，朝天宮街道46565人，安品街道31458人，芝麻營街道37648人，南湖街道79239人，興隆街道92889人。
2002年，雨花臺區沙洲、雙閘街道辦事處、江心洲鎮劃歸建鄴區管轄；建鄴區朝天宮、芝麻營街道辦事處屬白下區管轄；建鄴區漢中門大街及其向西延伸至長江以北的部分，歸鼓樓區江東街道辦事處管轄。鼓樓區漢中門街及其西延至長江以南段，屬建鄴區興隆街道辦事處管轄。撤銷江心洲鎮，成立江心洲街道辦事處(2003年正式成立)。
截至2009年底，建鄴區下轄南湖街、濱湖街、興隆街、南苑街、雙閘街、沙洲街、江心洲街7個街道，區政府駐沙洲街(南京市江東中路269號)。