為了知道陶弘景的說法是否正確，李時珍親自上山觀察。在樵夫和獵人的幫助下，他抓到了壹只穿山甲。從它的胃裏解剖出大約壹升的螞蟻，證明穿山甲動物是吃螞蟻的。陶弘景是對的。
但他從觀察中發現，穿山甲吃螞蟻時，是撓窩舔窩，而不是把螞蟻引誘到甲胄裏，吞到水裏。李時珍肯定了陶弘景的正確壹面，糾正了他的錯誤。
就這樣，李時珍經過長期的實地考察，找出了許多藥物的疑難問題，並於萬歷五寅年(公元1578年)完成了《本草綱目》的編纂。全書約200萬字，52卷，收錄藥物1892種，新藥374種，載體10000多種，圖片1000多幅，是我國前所未有的藥理學巨著。
其中糾正了許多錯誤，在動植物分類學等許多方面取得了突出的成就，對其他相關學科(生物學、化學、礦物學、地質學、天文學等)也有貢獻。).達爾文稱贊它是“中國古代的百科全書”。
擴展數據:
李時珍重視臨床，推崇張，重辨病證，嚴格立法，合理用藥。在治療上，對古方進行修改，或制定新方，或使用民間單方更有效。
李時珍的學術思想和研究方法很有特色。在新的歷史條件下，他根據自己的實踐經驗，改進了古代的科學方法，積累了新的科學研究經驗。李時珍成功地運用了觀察與實驗、比較與分類、分析與綜合、批判繼承與歷史考證等方法。
①觀察和實驗是本草研究的基本方法。李時珍親自收集並仔細觀察藥物以得出真相的方法非常成功。分類是科學研究的重要任務，藥物研究系統化的關鍵是如何建立分類標準。
李時珍打破了本草學中長期存在的上中下分類，確立了三界十六部的分類，使分類體系更加科學。此外，他在陶弘景主藥分類的基礎上，建立了更加完善的百病主藥分類，創立了入經藥分類。
(2)李時珍提出了八項任務，即釋名、集釋、辨疑、糾錯、修、嗅、主治、發明、附方，以求弄清每壹種藥物。這八項任務並不是都有的，有的是五到六項。實際上是對每壹種藥物的系統分析和全面綜合，並在分析的基礎上高度概括和全面。
③批判繼承和調查研究是李時珍研究的重要方法。他在研究每壹種藥物時，總是先查閱各種草藥，評價其異同，並自己觀察試驗結果，加以參考:《本草經》只載枸杞之名，而不指明藥用部位；名醫別錄指出根寒，子微寒。
李時珍經過研究，在批判繼承的基礎上，推陳出新，“在前人沒有去過的地方發展”。這種精神貫穿了他的全部研究活動。
(4)李時珍親力親為，廣泛向勞動人民學習，註重調查研究，這是另壹種重要的研究方法。關於壹種藥有很多種說法，有的像酸漿，有的是蒼耳，有的叫地。李時珍經過廣泛的咨詢，采集了各種草藥看真相，得出的結論是:肥肉是豬膏之母。他從京城回來，看到車夫用旋覆花治療跌打損傷，就肯定了他補氣強筋、補勞的貢獻。
隔壁孩子吃的是糧食，偶爾吃羊身上的，但都吐出來了，所以李時珍最先把這個品種引入草藥。他從狩獵的記述中知道虎骨有強身健體的作用；從菜農那裏，很清楚油菜是油菜，從工人那裏，他學會了如何防止采礦中毒。山民、漁民、農民、鞋匠、獵人都是他的老師，這讓他在調查研究中受益匪淺。
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