從元順帝到元朝(1264—1294),東南賊起,張士誠往來蘇杭,臨平為運河隧道,嚴光寺、安音寺、靜興寺無法保護。如果這個龍興寺再被破壞,碑文和碑文都會消亡。
明太祖洪武六年(1383),重建龍興寺,改名“龍興”。洪武二十四年(1391),朝廷宣布天下名剎為叢林,其余寺院下令合並。當時,塘棲的大山寺和劉清寺,臨平的嚴光寺和安音寺,喬司寶卿寺和覺仁寺,博魯惠日寺和聽知羅漢寺都像叢林壹樣矗立著。臨平的龍興寺、月華寺,小林的蓮花院、嚴光寺與慈悲院合並,平陵山孤寺、潮汕山報恩滿寧,歸安音寺。
清初,僧人欣然重修龍興寺,易冷易熱。“西冷十子”之壹的臨平詩人沈倩寫有《重修龍興寺籌款》,後被收入《東江募捐》壹書。久而久之,龍興寺就毀了。
1952年3月,在龍興橋舊址開辦私立臨平中學,龍興寺從此廢棄。1996重建龍興寺,寺址遷至南苑街道東湖村。2003年,由石立靜主持新建的龍興寺占地10畝,有大雄寶殿、天王寶殿、觀音寶殿。它還附屬於老臨平寺廟,如大北寺,慧雲寺,寺,北大寺,南湖寺和郭墓寺。