元朝至正二十七年（1367年）四月，吳王朱元璋命中書右丞相徐達為征虜大將軍、平章常遇春為副將軍，率軍25萬，誓師北進中原。北伐檄文中提出“驅逐胡虜，恢復中華，立綱陳紀，救濟斯民”的口號，直接以反蒙元為號召。
第二年，1368年正月，朱元璋正式開創明朝稱帝，建元洪武。徐達、常遇春的北伐大軍先攻占山東，然後由東到西席卷華北大地。
1、
而元朝此時還在忙於內訌，皇太子削擴廓帖木兒爵邑，命禿魯、李思齊等進攻擴廓帖木兒。蒙元統治階層的內訌在明軍不斷攻城掠地時，照樣持續了半年之久，等到當年八月雙方講和時，明軍已經直逼大都了。
《元史》記載：
“ 閏月己亥朔，擴廓帖木兒殺貊高、關保。
庚子，徐達陷衛輝路，壬寅，陷彰德路，丁未，陷廣平路。
壬子，明將常遇春陷德州。
丁巳，罷大撫軍院，殺知大撫軍院事伯顏帖木兒，復擴廓帖木兒官爵。皇太子總天下兵馬，裁決庶務如前詔。
戊午，明兵陷清州，辛酉，進至直沽，右丞相也速等潰走。癸亥，平章政事俺普等與明兵戰於河西務。敗績。
甲子，常遇春陷通州，知樞密院事蔔顏帖木兒敗績，死之。 ”
常遇春在8月底的時候已經打到了通州，明軍已經在大都城的大門外了。
洪武元年（1368年）9月10日，元順帝妥懽帖睦爾在大都皇宮清寧殿，召見群臣宣布駕臨上都。
聽到這壹消息，百官立即明白皇帝陛下是要放棄大都逃跑了。左丞相失列門、知樞密院事黑廝、參知政事郭庸及宦者趙伯顏不花反對，稱放棄京城無異於宣布王朝滅亡。
但是，妥懽帖睦爾去意已決。當夜，皇帝壹行百余人，包括奇皇後、三宮後妃、皇太子及其妻妾、高官、年幼的皇室成員，悄悄穿過京城西北的健德門，離開了京城，將高聳屹立的城墻拋在身後。
此後，黃金家族的皇室成員們再無壹人回到過大都。他們只能在夢想和回憶中憧憬大都昔日的繁華。
2、
次日，皇帝壹行抵達居庸關。居庸關的石墻上飾有佛教轉輪王的精美雕像。居庸關作為防禦堡壘，不僅控制從北方通往大都的主要驛站，而且其本身也是具有政治宗教意味的紀念碑。14世紀40年代，居庸關為慶祝元順帝妥懽帖睦爾登基而營建，此時卻被皇帝本人拋在身後，高聳的關門目睹了元朝帝國的崩塌。
元順帝離開大都的第三天，洪武元年（1368年）農歷八月二日，西歷9月13日，徐達大軍自大都齊化門外填濠而入，攻占大都。
蒙古史籍《黃金史》、《蒙古源流》記載，元順帝北逃時作了壹首蒙文詩歌：
諸色珍寶修成的我那寶貴宏偉的大都城喲，
愜意消夏而居的我那上都開平庫兒都城喲，
古時諸聖的夏營地我那上都的失喇塔喇喲，
在那萬物枯黃的戊申年，我誤失了大國喲！
九色珍寶裝修成的我那宏偉的大都喲，
可執縛九十九匹白馬的我那上都開平喲，
廣受眾惠的我那政教二道的福樂喲，
稱為天下之主我那可惜的美名喲，
起早登高舉目遠望，煙霞繚繞，前後眺望觀賞，景色悅目，
不分冬夏，居住無憂快活，
是我自在薛禪皇帝建立的寶城大都！
先祖享樂的我那寬廣宏偉的大都喲，
有緣相聚的我那眾王侯、宰相和屬民萬眾喲，
不聽亦剌忽丞相明諫之言，是我的遺恨，
聽信反叛而去的朱哥官人，是我的昏昧！
誤殺具足智慧的脫脫太師，
逐回大德上師，是我的罪過。
可惜我萬眾之主的皇帝的名聲！
可惜我那盡情享受的快樂！
具有神力的薛禪皇帝多方營建的，
福祿匯集的我那大都城喲！
被漢人朱哥官人收占去了！
惡名落到我妥歡帖睦爾身上了！
滿篇懊惱後悔的意思，但已經無濟於事。
這個月的月末，妥懽帖睦爾壹行頂著雨雪寒風來到上都。上都原本是元朝夏都所在，此時卻顯得很淒慘地孤零零矗立在那裏，因為城內城外的大部分建築在紅巾軍的多次進攻下已化為灰燼。在上都，元朝皇帝壹行慘淡地熬過了整個冬天。
妥懽帖睦爾和他的大臣們壹直想著各種不靠譜的法子想要扭轉局面：今後是應該收復大都，還是繼續逃亡至哈拉和林？有大臣要找高麗這個表面盟友的出兵援助，有人打算讓擴廓帖木兒趕來援助，朝廷確實在年底封擴廓帖木兒為齊王。但明軍攻勢如潮，擴廓帖木兒自顧不暇，在1369年1月被明將徐達在保安州擊敗。
所有的策劃都是壹團漿糊，屢試屢敗，屢敗屢試。流亡朝廷陷入絕望的氛圍，大臣們或者沈溺於美酒，醉生夢死，或者投入高麗美女的溫柔鄉。也有大臣義憤填膺地站出來，斥責他人貪生怕死，碌碌無為。而此時，妥懽帖睦爾在明軍日益逼近的強大壓力下，纏綿病榻，無法上朝。
3、
1369年六月中，也速與明將常遇春戰於全寧州，大敗。甲戌，明軍攻陷大興州，元朝中書右丞脫火赤被俘。元朝所剩無幾的能打仗的將領之壹李思齊，以臨洮降於明軍，流亡朝廷被明軍逼得不得不繼續奔北而逃。
1369年7月底，妥懽帖睦爾壹行離開上都遷往應昌落腳。他們前腳剛離開，常遇春的大軍後腳就攻占了上都。
《元史》記載：“ 冬十月丁未，明主復遣使賫手書來。 ”朱元璋給妥懽帖睦爾送去壹封言辭比較客氣的勸降信，蒙元皇室諸人及大臣們無言以對。
妥懽帖睦爾看著朱元璋的勸降書，哀嘆良久，然後以漢語作了壹首七言律詩來答復，題為《答明主》：
金陵使者渡江來，漠漠風煙壹道開。
王氣有時還自息，皇恩何處不昭回。
信知海內歸明主，亦喜江南有俊才。
歸去誠心丁寧說，春風先到鳳凰臺。
元順帝在詩中不說自己亡國，只是說自己是禪讓明主，但這只是為了保存顏面，自欺欺人而已。他們還寄希望高麗援軍，但實際上高麗國已經與明朝暗通款曲，向明朝稱臣了。年底，妥懽帖睦爾終於壹病不起。
1370年，明朝洪武三年，元朝至正三十年春正月初三日，朱元璋命右丞相徐達為征虜大將軍，浙江行省平章李文忠為左副將軍，都督馮勝為右副將軍，禦史大夫鄧愈為李文忠副將，中山侯湯和和為馮勝副將，出兵進攻此時蜷縮在草原與中原邊界的元朝殘余勢力。
此為明軍的第壹次北伐蒙古草原，分兵為二道：壹令大將軍自潼關出西安搗定西，以取王保保（即擴廓帖木兒）；壹令左副將軍李文忠出居庸關入沙漠以追元主，使其彼此自救，不暇應援。
二月，李文忠陷興和，進至察罕腦兒，擊敗元軍平章政事竹貞所部。
夏四月，擴廓帖木兒與徐達戰於沈兒峪，被明軍擊敗。
1370年5月23日，常年諸事不順、飽受痢疾之苦的妥懽帖睦爾在應昌離世，在位三十七年，年五十有壹。明太祖朱元璋認為他“知順天命，退避而去”，逃離大都時沒有做焚城之事，因此很客氣地給了他壹個“順帝”的謚號。
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妥懽帖睦爾之子，皇太子愛猷識理達臘如願以償即位當上了皇帝，後稱為元昭宗。這位不安分的太子殿下，接受過完整系統的漢文化教育，能寫詩會畫畫，是元朝崩潰滅亡的禍首之壹：他曾幾次試圖篡位，還與自己的皇帝老爸打內戰，但都沒有成功，只是加速了大元的崩潰。在妥懽帖睦爾去世十四天後，農歷五月二十壹日，李文忠大敗應昌府的北元守軍，攻陷應昌，捕獲了上千頭牛羊，只有昭宗率十余騎突圍，出奔和林（今蒙古國哈爾和林）。從此，元朝殘余勢力被稱為北元。
愛猷識理達臘的兒子買的裏八剌及其侍妾被明軍俘獲，被押送到南京，交給朱元璋。直至1374年，他們壹直“客居”南京。新任元朝皇帝兒子被明朝俘虜，自己也喪失了中原這壹龐大資源，其部將也越來越如狼似虎地覬覦皇權，直至1378年去世，大元皇帝愛猷識理達臘，壹直是朱元璋最大的威脅之壹。
愛猷識理達臘的壹輩子顛沛流離，幾次處於被廢、被殺的危機中，即位之後極力要反攻中原，但總是無法成功。在他死前，唯壹可以自我安慰的，那就是他比擴廓帖木兒（卒於1375年）要長壽。擴廓帖木兒壹直效忠妥懽帖睦爾，曾在1365年拒絕與奇皇後壹齊擁戴愛猷識理達臘即位。
奇皇後是元昭宗愛猷識理達臘的母親，高麗貢女出身，元順帝妥懽帖睦爾確實曾計劃逃亡高麗沿海地區的耽羅島（今濟州島）。在蒙元帝國滅亡的滾滾 歷史 潮流中，元昭宗愛猷識理達臘的多年反攻中原的努力，只是小小的浪花，沒能翻滾幾下，就消失不見了。退回草原的元朝殘余勢力，至此後只是草原割據勢力。1378年，洪武十壹年四月，愛猷識理達臘去世，廟號昭宗，汗號必裏克圖汗（Biligtü，蒙古語意為“聰明的”）。十年後，明軍大破北元於捕魚兒海，殲滅蒙古騎兵7萬余人，俘獲北元皇帝次子地保奴、妃、公主以下百余人，吳王朵兒只、代王達裏麻及平章以下官屬三千人，男女七萬七千余人。北元皇帝脫古思帖木兒在逃亡途中，遭到蒙古其他力量毒手。至此，北元徹底崩潰。
參考書籍：《元史》、《明史》、《高麗史》