吳昌碩的繪畫既有文人畫的飄逸風格，又融入了世俗與平民的因素，呈現出壹種雅俗共賞的特點。在吳昌碩的畫作中，我們經常看到梅、蘭、竹、菊、水仙等傳統文人畫。他以梅、水仙為友，以石為自畫像，卻又脫俗脫俗。
比如牡丹是富貴的象征，市民都喜歡給牡丹上色，但畫牡丹容易入俗，所以他常常用水仙或頑石來畫牡丹，讓兩者和諧相處，雅俗相映。
晚清時期，隨著金石學的盛行，許多精於金石學碑刻和書法篆刻的畫家，將深厚精湛的金石學素養和技藝註入到他們的繪畫中，他們的繪畫表現出瑰麗的金石學魅力。吳昌碩幾十年來致力於石鼓文研究，其石鼓文書寫具有創新性，寫作風格獨特。
吳昌碩將金石學書法的經驗充分運用到繪畫創作中，形成了自己的風格。篆刻常用於畫梅、蘭、蓮。他筆下的梅花有紅梅、青梅、雪中梅、月下梅。他很少寫整棵李樹，卻經常成群結隊地寫，表現李樹的不同情況。
吳昌碩畫梅花時，說的是“掃”而不是畫。“掃”字恰到好處地透露出他畫梅花時，是對自己的生活感興趣，有壹種快而活潑的神態。
吳昌碩畫葡萄、紫藤等植物時，常用草書筆法。他的草書還融入了篆書的味道，真可謂“強抱篆為壹株野草”。