南洞庭湖濕地由於湘、黔、元、李、長江水的交匯，具有沼澤地貌的特點，河流、島嶼眾多，118無人居住的湖泊、島嶼遍布於浩瀚的湖中。
南洞庭湖不僅是大自然的迷宮，更是生物遺傳基因庫。生態環境優良、水域遼闊、風情多樣的湖泊濕地有濕地植物863種、鳥類164種、魚類114種。其中有中華鱘、白鶴、白頭鶴、中華秋沙鴨等國家壹級保護動物10余種。湖州蘆葦占地24000公頃，是世界上最大的蘆葦群落。