使用預處理軟件對PDF文檔的頁邊距進行修剪，例如使用修剪軟件Briss去除PDF文檔的頁邊距以使可讀區域盡可能大，然後將生成的PDF文檔放入Kindle中進行閱讀。有些文件在切割後可以很好地閱讀，但有些文件在處理後仍然太大。
使用OCR（光學字符識別）軟件，PDF中的文本被提取並導出為其他可以重新排列的文檔格式，如TXT和MOBI。由於OCR具有壹定的識別錯誤率，並且無法保持排版樣式（如字體、字號和圖表公式），因此該方法的應用範圍受到限制。
使用閱讀器提取文檔中的字符和樣式，並以適合屏幕寬度的方式重新排列它們（稱為文本重排，文本
回流）。雖然這種方法可以保留字體樣式信息，但它對圖表和公式的支持不如第二種方法。這種方法的另壹個缺點是無法重新排列掃描的文檔，因為無法從掃描的文檔中提取字符和格式信息。
Koreader的重排功能離不開另壹個開源軟件項目k 2 pdfopt（GPL v3協議發布）。K2pdfopt也是為了解決小屏Kindle閱讀PDF文檔的排版問題而開發的。與其他PDF預處理軟件相比，它具有許多獨特的功能，例如自動化程度高，自動識別多列排版文檔，自動去除頁面白邊，自動水平校正掃描文檔，以及最重要的基於圖像分割的重新排版算法。K2pdfopt使用完全基於圖像處理的方法來重新排列文本。軟件在處理時，會將原始PDF/DJVU頁面放大並以單詞為單位劃分為像素區域，並將這些像素區域重新排列到目標寬度的頁面中（原理如下所示），因此理論上只要文檔的頁面像素可以閱讀，就可以重新排列文本。這種算法的前提是頁面中的文字之間需要有壹定的間隙，以提供劃分像素區域的場地。