支原體和衣原體感染都是性傳播感染，所以治療時男女都要壹起治療。治療壹周後檢查結果正常，還要繼續鞏固治療壹周。支原體、衣原體感染在機體抵抗力下降的情況下仍容易復發，需要加強營養，增強體質。合理安排休息時間，不熬夜，不吃刺激性食物。
支原體和衣原體有很多種。支原體、衣原體感染後，首先要進行醫學檢查，確認支原體的種類及其對藥物的敏感性。除了適當休息、合理飲食等壹般治療外，還要及時糾正水、電解質、酸堿失衡，治療發熱、咳嗽、咽痛、胸痛、皮膚瘙癢等癥狀。根據藥敏試驗結果，接受適當的抗生素治療。