康熙六年前考取秀才,致力於古樂律的考證,為後來的戲曲創作奠定基礎;他還廣泛涉獵禮儀、音樂、軍事和家庭研究。康熙17年隱居在曲阜縣東北的石門山建宅,讀書寫作,後來編纂了《石門山集》。國子監誕生於康熙二十年。清朝南巡時推薦孔子講學,得到賞識。康熙二十四年,為國子監博士。此後,他參加了疏浚黃河口的工程,了解了淮陽生活的現實,寫詩反映人民的疾苦,譴責了官場的黑暗。後來的詩是《湖海集》。我去過明朝的江南。兩年後,承德被封。
康熙三十八年(1699)六月,桃花扇傳說出版。北戲的創作經歷了10多年,三易其稿。該劇結構巧妙細致,情節跌宕起伏。它以復社文人與秦淮名妓李的愛情故事為基礎,在廣闊的社會歷史生活圖景中反映了南朝王朝的覆滅。題材積極向上,在人物塑造和戲劇表現力的發掘上頗有建樹。問世後,迅速傳播開來,廣受好評。它和《長生殿》壹起被稱為明清傳奇的傑作。
孔後來升任住房部廣東司外交部長,後因被誣告(說他被誣涉貪汙案)而被免職。回京後,他寫了壹首詩《唐嫣草稿》。後在山西學習《平陽府誌》,遊歷武昌等地,與劉廷謙合作《長留集》。康熙57年(1718)卒於家鄉曲阜。
《桃花扇》在中國戲曲發展史上占有重要的地位。許多歌劇被移植並翻譯成多種語言進行傳播。