黃河水汙染趨勢發展迅速。流域內城鎮工業和生活廢水排放量從1.980年的21.7億噸增加到2003年的41.5億噸，相當於全國的10%，河流汙徑比達到10%左右。
劣於ⅲ類水的黃河主要支流長度從20世紀80年代的40%上升到90年代末的60%，本世紀以來達到70% ~ 80%。2004年，黃河幹流83個重點監測斷面和27條主要支流中，72.3%的斷面劣於地表水環境質量ⅲ類標準，其中19.3%為ⅳ類水，9.6%為ⅴ類水，43.4%為劣ⅴ類水。黃河幹流近70%的城市集中式飲用水源不能達到水質標準要求。嚴重的水汙染威脅著供水安全，壹些河段和地區形成了缺水現象，造成了巨大的經濟損失。
(C)流域用水效率低
由於水價嚴重偏低，黃河水資源的浪費和低效沒有得到有效遏制。從2001到2004年，黃河供水區平均從農田灌溉中取水270億立方米，成為黃河的主要用水戶。由於管理粗放，種植結構不合理，灌溉工程配套性差，灌溉水利用系數只有0.4左右。大中城市工業用水重復利用率只有40% ~ 60%。2000年黃河供水區萬元GDP用水量為674立方米，相當於淮河、海河、遼河流域的1.5 ~ 2.0倍。
(D)水資源管理和調度實施仍不到位。
水量調度管理手段薄弱。目前，黃河水資源的統壹管理和調度主要依靠行政手段和技術手段。由於法律責任不明確，部分省(區)仍存在超指標調水現象。由於水權分配尚未到達市縣以下行政區域，原有取水許可管理制度不具有約束力，黃河支流取水許可管理薄弱，部分省(區)難以完全控制總量。