在對親緣關系的認識中，比較形態學上的相似性，以及其他生殖方法、雜交試驗、血清學分類等是非常重要的。經常被使用。
自然分類系統——基於動物形態或解剖學上的異同，基於古生物學、比較胚胎學和比較解剖學的諸多結論，基本反映了動物“大家庭”中的自然親緣關系。
如何確定
隨著現代新設備、新技術、新思想的發展，特別是電子計算機的應用，分類學數據的處理大大加快，通過學科的滲透，分類學建立了新的標準。
比如:根據某些蛋白質類型區分同壹物種；根據決定生物特征的遺傳物質DNA的不同，區分生物；根據免疫學標準和行為學標準，確定生物之間的關系。