擔子菌壹般稱為擔子菌，是最高級別的真菌。擔子菌的同域特征是有性生殖產生擔孢子。擔孢子產生於擔孢子上，壹般每個擔孢子上形成四個擔孢子。高等擔子菌的擔子菌生長在高度組織化的結構上，這種結構稱為擔子果。常見的擔子菌如木耳、銀耳、蘑菇、靈芝都是擔子菌的擔子果。低等擔子菌的擔子菌是裸露的，沒有擔子果。擔子菌多為腐生菌，許多能形成大的擔子果，擔子果常產於腐朽的木材和植物雕落物上。有些擔子果可以食用或藥用，而有些是有毒的。壹些擔子菌寄生植物引起嚴重的疾病。其中少數與植物形成菌根。
隨著研究的深入，所采用的分類性狀也在不斷更新，已經從子實體的外部形態深入到內部的精細結構，如根據是否有擔子果、鎖結組合、桶孔隔膜、桶孔蓋墊等進行分類。《真菌大辭典》第八版(1995)將擔子菌分為三類，分別是冬蟲夏草、黑粉菌和擔子菌。