使用預處理軟件對PDF文檔的頁邊距進行修剪，比如使用修剪軟件Briss去除PDF文檔的頁邊距，使可讀區域盡可能大，然後將生成的PDF文檔放入Kindle中閱讀。有些文件切割後可以很好地閱讀，但有些文件處理後仍然過大。
使用OCR(光學字符識別)軟件，PDF中的文本被提取並導出為其他可以重新排列的文檔格式，如TXT和MOBI。由於OCR有壹定的識別錯誤率，不能保持排版樣式(如字體、字號、圖表公式)，這種方式的應用範圍受到限制。
使用閱讀器提取文檔中的字符和樣式，並以適應屏幕寬度的方式重新排列它們(稱為文本重排，文本
回流).這種方法雖然可以保留字體樣式信息，但對圖表和公式的支持不如第二種方法。這種方法的另壹個缺點是不能重新排列掃描的文檔，因為不能從掃描的文檔中提取字符和格式信息。
Koreader的重排功能離不開另壹個開源軟件項目K2pdfopt(GPLV3協議發布)。K2pdfopt也是為了解決小屏幕Kindle閱讀PDF文檔的排版問題而開發的。與其他PDF預處理軟件相比，它具有許多獨特的功能，如自動化程度高，自動識別多列排版文檔，自動去除頁面白邊，自動水平校正掃描文檔，以及最重要的基於圖像分割的重新排版算法。K2pdfopt使用完全基於圖像處理的方法來重新排列文本。軟件在處理的時候，會把原來的PDF/DJVU頁面放大，以字為單位劃分成像素區域，把這些像素區域重新排列成目標寬度的頁面(原理如下圖)，所以理論上只要文檔的頁面像素可以被讀取，就可以重新排列文字。這個算法的前提是頁面中的文字之間需要有壹定的間隙，以提供劃分像素區域的場地。