由於元世祖委托佛教八思巴制作了另壹個八思巴字，每個字都被稱為“吳偉”，以示區別。然而，盡管屢禁不止，當時的蒙古人還是喜歡使用維吾爾蒙語，於是，巴斯巴壹詞就被轉移到了其他語言中。在明朝建立和元順帝回歸北方之前，八思巴這個新詞很少被使用。靈北等蒙古族仍以回鶻字體為正宗。
16世紀，蒙古信佛，廣譯佛經，所以蒙古文字流行定型。所以十六、十七世紀之交是蒙古的文藝復興時期。在此之前，對寫蒙古語的壹些缺失部分進行了改進。這時候引入了很多藏語和梵語的內典術語，來代替過去蒙古人使用的詞匯。並且為了方便藏語和梵語音的翻譯，創造了另壹種變體字母。字母的改進主要在Arigari。1587年，喀喇沁的翻譯家阿尤什古史修改了舊字體，創造了自己的阿裏嘎日字體，可以表示所有的藏語和梵語音，還可以表示蒙古語中沒有的輔音。這個時候，壹些老話就被廢棄不用了。學術界稱此時的書面蒙古語為古典蒙古語。
清代還借鑒蒙古字體，用滿文的書創造滿文。兩種字體相似，可以繞過。此後，從十七世紀末到十八世紀，古典蒙古語得到了充分的發展。雕版印刷在北京和內蒙古盛行，精通蒙語或藏語巫師的皇帝參與編纂字典和語法書。
1648年，衛拉特蒙古和碩特部僧人紮雅班迪達也改進了傳統，分析了蒙古文字的音標，創制了新字體“托多蒙γol”。但這種新字體只在天山南北路和伏爾加河口使用過，在東蒙古地區沒有采用。
1686年，廓爾喀僧人哪咤·巴紮爾模仿藏語梵文，創造了索永布字體，有90個字母，左起壹橫，能準確表達藏語、梵語、蒙古語音。索永布的字體非常漂亮，寺廟經常用它來裝飾。可惜這種字體比八思巴寫字不方便，所以在社會上很少使用。同年，紮納·巴紮爾制作了另壹種橫版文字，在廓爾喀的佛教寺廟中使用。
二十世紀初曾有過關於蒙古文字拉丁化的討論，但當時並未付諸實踐。從1946開始，蒙古改為用西裏爾字母拼寫喀爾喀語口語。中華人民共和國內蒙古自治區仍然采用繁體字。