子實體基本上由以下部分組成:
1.紫蘇。為了包裹所有的孢子和內部成分,它們大多是膜狀的,很薄,也是像軟骨類的硬物種。子實體成熟時,某些屬如百部菌屬(黏菌屬)的周皮已經完全消失,或僅保留壹部分,如篩菌屬(黏菌屬)和弧菌屬(黏菌屬)。
4.梗。在有莖的物種中,莖的質地、顏色和長度也是分類和鑒定所依據的特征。
3.骨灰堂。位於孢子囊中,是柄的延伸,存在於百部綱(黏菌綱)、酸漿綱(黏菌綱)和棘孢綱(黏菌綱)的壹些成員中。在莖鞘目中,它是細長的,而在Physarales目中,它有各種各樣的變異形式和石灰質。在無柄種中,孢子囊軸可能在孢子囊底部加厚或拱起。如果孢子囊中有類似孢子囊軸的東西,但不連在柄的頂端,而是漂浮在孢子群中,則稱為假囊軸。
4.孢子。大多呈圓形,大小、表面紋理、顏色都被認為是穩定的特征。在反射光下,黏菌根據孢子顏色可分為兩類:1)淺色至亮色群,如李氏菌目(黏菌)和毛菌目(黏菌)(2)深色(褐色至近黑色)群,如絨泡菌目(黏菌)和百部菌目(發網)。
5.毛細血管。為了幫助孢子傳播,絲線結構可以是單根彈性線(如毛黴毛絲)或長而分支並連成網。Physaraceae的細毛中含有鈣質顆粒,Didymiaceae則沒有。細毛的特征(包括表面的各種花紋)是鑒定目、科、屬、種的非常重要的依據。假毛狀體通常只存在於大量的子實體中,如粘菌粘液瘤,並且通常表現為不規則的管、樹枝狀分枝或穿孔的膜。
6.下丘腦。位於子實體基部,可以是圓盤狀,單個,在單個子囊果基部展開,也可以是延長使壹組單個子囊果有壹個基膜。大多數黏菌都有明顯的基膜。