大多數海洋真菌生活在壹定的基質中,只有少數真菌不依賴基質自由生活。海洋真菌按其生境習性可分為五個基本生態類型,即木本真菌、寄生藻類真菌、紅樹林真菌、海藻真菌和寄生動物真菌。
海洋真菌在海洋食物鏈中扮演著重要的角色。它們參與海洋有機物質的分解和無機營養物質的再生,為海洋生物提供生命所需的物質。特別是在海洋沈積物中,真菌和酵母是許多海洋動物的食物來源。壹些海洋真菌能產生抗生素和結構獨特的活性物質,在生態學和應用方面有重要作用,如降解海洋中的汙染物,促進海洋自凈等。利用海洋真菌加工麥麩、蔗渣、稭稈等。,可制成微生物碎屑混合物,用作水產養殖的飼料。這種做法具有可持續發展、高質量和低成本的優勢。