1.疼痛肛裂可因排便引起周期性疼痛，這是肛裂的主要癥狀。排便時，糞塊刺激潰瘍面的神經末梢，立即感到肛門灼痛，但排便後幾分鐘疼痛減輕。這個時期被稱為疼痛間歇期。後來由於內括約肌痙攣，再次出現劇烈疼痛，可持續半小時至數小時，使患者煩躁不安，難以忍受，直至括約肌疲勞後肌肉放松，疼痛減輕。但是又排便，又痛。以上臨床癥狀稱為肛裂疼痛周期。疼痛也可放射至會陰、臀部、大腿內側或骶尾部。
2.便秘這是肛裂的原因和後果。肛裂後，患者因為肛門疼痛而不願意排便，久而久之造成便秘，糞便更加幹硬。便秘會加重肛裂，形成惡性循環，使肛裂難以愈合。
3.便血排便時經常在糞便或衛生紙表面看到少量新鮮血液或血滴。大出血很少見。
4.其他如肛門瘙癢、分泌物、腹瀉等。肛門瘙癢癥(表1)是由肛裂潰瘍分泌物或肛隱窩炎、肛乳頭炎產生的分泌物引起的。
5.體征國外曾報道355例肛裂有以下不同體征:肛管痙攣78%，前哨痔68%，乳頭肥大25%，肛瘺6%，括約肌膿腫4%，痔瘡38%，肛管狹窄2%。
壹般都有排便秘史。在詢問排便史和是否有排便疼痛史時，往往會出現典型的排便後疼痛間期和疼痛周期。如果局部檢查發現肛裂“三聯體”在肛管中部，則診斷明確。對於位於側臥位的慢性潰瘍，需要考慮是否有結核、癌癥、克羅恩病、潰瘍性結腸炎等罕見病變，必要時進行活檢。