基因在染色體上，也就是說染色體是基因的載體，減數分裂中基因行為和染色體行為之間存在著準確的平行關系。在真核生物中，基因只成對存在，稱為等位基因，而染色體也成對存在，稱為同源染色體；形成配子時，等位基因相互分離，進入不同的配子，壹對同源染色體也在第壹次減數分裂時相互分離，移動到細胞的兩極。不同基因在形成配子時自由進入配子，非同源染色體也是如此。