1.不同作者:《毛澤東文選》的作者是毛澤東，《毛澤東文集》的作者是中共中央文獻研究室。
2.內容不同:《毛澤東文選》是毛澤東思想的重要載體，是毛澤東思想的集中展示，是20世紀對中國影響最大的書籍之壹，而《毛澤東文選》全面、充分地反映了毛澤東思想的科學體系及其形成發展過程，展現了建國後毛澤東對社會主義建設的新探索，對學習和研究毛澤東思想具有重要的科學價值。